Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00853 AP23489638-KC-24 0124РК00649
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 33810168 AP23489638
Name of work
Изучение популяционного и генетического разнообразия глазной микробиоты КРС при инфекционном кератоконъюнктивите
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Шевцов Александр Борисович
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Бактериальные культуры собранных мазков слезной жидкости здоровых телят и телят с инфекционным кератоконьюктивитом, ДНК из мазков и выделенных культур

Сау және инфекциялық кератоконьюктивиті бар бұзаулардың көз жасы сұйықтығының жағындыларынан жиналған бактериалды дақылдар , жағындылар мен дақылдардан бөліп алынған ДНҚ

Изучить изменения в микробиоте глаз у телят с различной степенью тяжести инфекционного кератоконъюнктивита и провести полногеномное секвенирование видов бактерий численность которых увеличивается при инфекционном процессе

Жұқпалы кератоконьюнктивиттің әртүрлі ауырлық дәрежесіне ие бұзаулардың көз микробиотасындағы өзгерістерді зерттеу және инфекциялық процесте саны артып келе жатқан бактерия түрлеріне толықгеномды секвенерлеу жүргізу

Были использованы микробиологические, молекулярно-генетические и биоинформатические методы исследований

Микробиологиялық, молекулалық-генетикалық және биоинформатикалық зерттеу әдістері қолданылды

Проведено полногеномное секвенирование ДНК 85 коллекционных штаммов M. bovis и M. bovoculi, выделенных от животных с ИКК из разных ферм в период 2018-2022 годов. В результате были получены полногеномные данные 85 бактериальных штаммов, кратность покрытия превысило 30. Проведен сбор биологических образцов от телят с ИКК различной степени тяжести и контрольной группы без ИКК с фермы №1 в количестве 100 образцов. Проведен 30-дневный контроль за клиническим состоянием животных с регистрацией отклика на терапию и присутствия/отсутствия ИКК в контрольной группе. Проведено выделение и идентификация бактериальных культур из собранных мазков слезной жидкости от телят фермы №1. Всего было выделено 75 бактериальных культур: Acinetobacter, Dietzia, Agrococcus, Bacillus, Bavariicoccus, Corynebacterium, Micrococcus, Moraxella, Staphylococcus и Streptococcus. Проведено выделение ДНК из мазков и выделенных бактериальных культур. Проведен анализ микробиоты глаза у телят с ИКК различной степенью тяжести и контрольной группы без ИКК отобранных в количестве 100 образцов из фермы №1 методом секвенирования регионов V3 и V4. Получены данные бактериологического разнообразия в мазках слезной жидкости от телят с различной степенью тяжести ИКК.

2018-2022 жылдар кезеңінде әртүрлі фермалардан, жұқпалы кератоконьюнктивитпен (ЖКК) ауыратын жануарлардан, бөліп алынған M. bovis мен M. bovoculi-дің 85 коллекциялық штаммының ДНҚ-на толықгеномды секвенерлеу жүргізілді. Нәтижесінде 85 бактериялық штаммның толық геномдық деректері алынды, қамту еселігі 30 дан асты.Ауру деңгейінің әр тұрлі кезеңіндегі ЖКК бар бұзаулардан биологиялық үлгілер жиналды және №1 шаруа қожалығындағы ЖКК жоқ бұзаулардан 100 үлгі бақылау тобы ретінде алынды. Терапия әсерін қадағалай отырып, жануарлардың клиникалық жағдайына 30 күндік бақылау жүргізілді және бақылау тобында ЖКК болуы/болмауы бақыланды.№ 1 шаруа қожалығының бұзауларынан жиналған көз жасы сұйықтығының жағындыларынан бактериалды дақыл бөліп алынып, оларға сәйкестендіру жүргізілді. Барлығы 75 бактериялық дақыл бөлінді оның ішінде бар: Acinetobacter, Dietzia, Agrococcus, Bacillus, Bavariicoccus, Corynebacterium, Micrococcus, Moraxella, Staphylococcus және Streptococcus. Бөліп алынған бактериалды дақыл мен жағындыдан ДНҚ бөліп алынды. Әр түрлі ауырлық дәрежесіндегі ЖКК бар бұзаулардың және V3 және V4 өңірлерін секвенирлеу әдісімен №1 шаруа қожалығынан іріктеп алынған ЖКК жоқ бақылау тобының 100 үлгісіне көздің микробиотасына талдау жасалды. ЖКК ауырлық деңгейі әртүрлі бұзаулардан жас сұйықтығының жағындыларынан бактериологиялық әртүрлілік деректері алынды.

Проанализирован микробиом слезной жидкости от телят с различной степенью тяжести ИКК и контрольной группы здоровых телят. Проведено полногенномное секвенирование 85 коллекционных штаммов M. bovis и M. bovoculi

Ауырудың әр түрлі дәрежесіндегі бұзаулардан және бақылау тобынан шыққан сау бұзаулардың көз жасы сұйықтығының микробиомасы талданады. M. bovis мен M. bovoculi-дің 85 коллекциялық штаммының ДНҚ-на толықгеномды секвенерлеу жүргізілді

Не внедрено

Еңгізілмеген

Данные микробиома глаз у здоровых животных и животных с ИКК, а также геномные характеристики персистирующих видов бактерий, улучшит понимание развитие ИКК и позволит разработать эффективные стратегии профилактики

Сау жануарлардағы және ЖКК бар жануарлардағы көз микробиомасының деректері, сондай ақ бактериялардың тұрақты түрлерінің геномдық сипаттамалары ЖКК дамуын түсінуді жақсартады және алдын алудың тиімді стратегияларын әзірлеуге мүмкіндік береді.

Биология, биотехнология и ветеринария.

Биология, биотехнология және ветеринария.

UDC indices
619:616-07,619:579.62
International classifier codes
34.15.00; 34.27.59;
Key words in Russian
ИНФЕКЦИОННЫЙ КЕРАТОКОНЪЮНКТИВИТ; МИКРОБИОЦЕНОЗ; ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ; MORAXELLA BOVIS; MORAXELLA BOVOCULI;
Key words in Kazakh
ЖҰҚПАЛЫ КЕРАТОКОНЪЮНКТИВИТ; МИКРОБИОЦЕНОЗ; ТОЛЫҚ ГЕНОМДЫ СЕКВЕНИРЛЕУ; MORAXELLA BOVIS; MORAXELLA BOVOCULI;
Head of the organization Огай Вячеслав Борисович Кандидат биологических наук / Профессор
Head of work Шевцов Александр Борисович Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор