Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00964 AP23488467-KC-24 0124РК00458
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 33912647 AP23488467
Name of work
Функциональная характеристика ДНК-гликозилазы золотистого стафилоккока
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Тургимбаева Айгерим Макашкызы
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

урацил-ДНК-гликозилаза UDG золотистого стафилоккока

Алтын стафилококктың UDG урацил-ДНҚ- гликозилазасы

биохимическая характеристика ранее неизученной ДНК-гликозилазы UDG золотистого стафилоккока

алтын стафилококктың бұрын зерттелмеген урацил-ДНҚ-гликозилаза биохимиялық сипаттамасы

методы молекулярной биологии и биохимии

молекулалық биология және биохимия әдістері

Из геномной ДНК S. aureus были амплифицированы гены udg (657 п.н.) и dnaN (1134 п.н.). Полученные гены были клонированы в промежуточный вектор pGEM-T для хранения, в результате были получены векторы pGEM-T/SaUDG и pGEM-T/SaDnaN. Для последующей хроматографической очистки были сконструированы экспрессионные векторы pET11a/SaUDG и pET28c/SaDnaN. Вектор pET11a/SaUDG позволяет получить рекомбинантный фермент SaUDG в нативной форме, а вектор pET28c/SaDnaN – рекомбинантный белок SaDnaN с шестигистидоновой меткой на N-конце для эффективной очистки с помощью аффинной хроматографии. Полученные рекомбинантные векторы были секвенированы методом Сэнгера: мутации и нарушения открытой рамки считывания не обнаружены. Были подобраны оптимальные условия для максимального выхода рекомбинантных белков Udg и DnaN (наиболее эффективный штамм-продуцент Escherichia coli, время и температура индукции, концентрация изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозида). Для сравнения эффективности экспрессии генов udg и dnaN были использованы штаммы Escherichia coli ArcticExpress (DE3), BL-21 (DE3) и Rosetta2 (DE3). Наибольшее накопление рекомбинатных белков Udg и DnaN в водорастворимой фракции клеточного лизата наблюдалось в штамме Rosetta2 (DE3). Оптимальные условия индукции рекомбинантных белков Udg и DnaN: температура индукции +22°С, время культивирования 16 часов, концентрация изопропил-β-D-1 тиогалактопиранозида 0,5 мМ.

S. aureus геномдық ДНҚ-сынан udg (657 н.ж.) және dnaN (1134 н.ж.) гендері амплификацияланды. Алынған гендер сақтау мақсатында pGEM-T аралық векторына клондалды, нәтижесінде pGEM-T/SaUDG және pGEM-T/SaDnaN векторлары алынды. Кейінгі хроматографиялық тазарту үшін pET11a/SaUDG және pET28c/SaDnaN экспрессия векторлары құрастырылды. pET11a/SaUDG векторы рекомбинантты SaUDG ферментін табиғи түрінде қамтамасыз етеді, ал pET28c/SaDnaN векторы аффинділік хроматографиясы арқылы тиімді тазарту үшін N-терминалындағы алты гистидин белгісі бар рекомбинантты SaDnaN ақуызын қамтамасыз етеді. Алынған рекомбинантты векторлар Сэнгер әдісімен реттелген: мутация немесе ашық оқу шеңберінің бұзылуы анықталған жоқ. Udg және DnaN рекомбинантты ақуыздарының максималды шығымдылығына қол жеткізу үшін оңтайлы жағдайлар анықталды (Escherichia coli-нің ең тиімді өндіруші штаммы, индукция уақыты мен температурасы, изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозид концентрациясы). udg және dnaN гендерінің экспрессиясының тиімділігін салыстыру үшін Escherichia coli ArcticExpress (DE3), BL-21 (DE3) және Rosetta2 (DE3) штаммдары қолданылды. Жасуша лизатының суда еритін фракциясында рекомбинантты ақуыздардың Udg және DnaN ең жоғары жинақталуы Rosetta2 (DE3) штаммында байқалды. Udg және DnaN рекомбинантты ақуыздарын индукциялау үшін оптималды жағдайлар: индукция температурасы +22°C, өсіру уақыты 16 сағат, изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозид концентрациясы 0,5 мМ.

---

---

Фундаментальные знания

Іргелі білім

UDC indices
577.15
International classifier codes
34.15.27;
Key words in Russian
патогены; репарация ДНК; Staphylococcus; рекомбинантные белки; бактерия;
Key words in Kazakh
патогендер; ДНҚ репарациясы; Staphylococcus; рекомбинантты ақуыздар; бактерия;
Head of the organization Огай Вячеслав Борисович Кандидат биологических наук / Профессор
Head of work Тургимбаева Айгерим Макашкызы Phd / нет