Inventory number | IRN | Number of state registration | ||
---|---|---|---|---|
0324РК00894 | AP23485953-KC-24 | 0124РК01002 | ||
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation | ||
Краткие сведения | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
||
Publications | ||||
Native publications: 0 | ||||
International publications: 0 | Publications Web of science: 0 | Publications Scopus: 0 | ||
Patents | Amount of funding | Code of the program | ||
0 | 32782809 | AP23485953 | ||
Name of work | ||||
Эпидемиология и молекулярная биология резистома патогенов птиц | ||||
Type of work | Source of funding | Report authors | ||
Fundamental | Коротецкий Илья Сергеевич | |||
0
0
0
0
|
||||
Customer | МНВО РК | |||
Information on the executing organization | ||||
Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |||
Full name of the service recipient | ||||
"Международный инженерно-технологический университет" | ||||
Abbreviated name of the service recipient | "Международный инженерно-технологический университет" | |||
Abstract | ||||
Трахеальные и клоакальные смывы, кровь, помет Трахеальды және клоакальды жуулар, қан, қоқыс Изучение распространенности и характеристик резистома бактериальных патогенов, выделенных из популяций домашних и промышленных птиц в Казахстане, что обеспечит основу для разработки эффективных стратегий борьбы с распространением устойчивости к антибиотикам в сельскохозяйственной и медицинской сферах Қазақстандағы отандық және өнеркәсіптік құстардың популяцияларынан оқшауланған бактериялық патогендердің резистомасының таралуы мен сипаттамаларын зерделеу, бұл ауыл шаруашылығы және медицина салаларында антибиотиктерге төзімділіктің таралуына қарсы күрестің тиімді стратегияларын әзірлеу үшін негізді қамтамасыз етеді Молекулярно-генетические (выделение ДНК, секвенирование), биоинформатические (выявление генов резистентности и механизмов их передачи), программирование (создание скриптов на языке программирования Python 3 для работы с данными). Молекулалық-генетикалық (ДНҚ оқшаулау, реттілік), биоинформатикалық (қарсылық гендерін және олардың берілу механизмдерін анықтау), бағдарламалау (деректермен жұмыс істеу үшін Python 3 бағдарламалау тілінде сценарийлер жасау). Собраны и систематизированы 60 образцов из различных географических регионов Казахстана, что позволяет впервые определить региональные особенности распространенности резистентности к антибиотикам у птиц. Проведено секвенирование ДНК 30 пулов образцов на платформе Ion Torrent PGM, что обеспечило высокую точность и детализированность данных. Проведен анализ ридов. Используя специализированное программное обеспечение Resistance Gene Identifier – RGI bwt, в бактериальном геноме идентифицированы гены, кодирующие элементы устойчивости к антибиотикам, определен механизм их резистентности. Қазақстанның әртүрлі географиялық аймақтарынан 60 үлгі жиналды және жүйеленді, бұл құстарда антибиотиктерге төзімділіктің таралуының аймақтық ерекшеліктерін алғаш рет анықтауға мүмкіндік береді. Ion torrent PGM платформасында 30 Үлгі пулының ДНҚ секвенциясы жүргізілді, бұл деректердің жоғары дәлдігі мен егжей-тегжейін қамтамасыз етті. Қатарларға талдау жүргізілді. Арнайы Resistance Gene Identifier – rgi BWT бағдарламалық құралын пайдалана отырып, бактериялық геномда антибиотиктерге төзімділік элементтерін кодтайтын гендер анықталды, олардың төзімділік механизмі анықталды. Разработка целенаправленных стратегий для борьбы с устойчивостью к антибиотикам позволит снизить затраты на лечение заболеваний у птиц. Это, в свою очередь, приведет к снижению потерь от болезней и увеличению производительности птицеводства. Полученные знания о механизмах и путях распространения устойчивости к антибиотикам помогут оптимизировать их использование, что сократит затраты на закупку антибиотиков и уменьшит риск развития устойчивости. Повышение качества продукции и уменьшение использования антибиотиков улучшат восприятие продукции на рынке, что может привести к увеличению спроса и, соответственно, доходов. Антибиотиктерге төзімділікпен күресудің мақсатты стратегияларын әзірлеу құстардағы ауруларды емдеуге кететін шығындарды азайтады. Бұл өз кезегінде аурудан болатын шығындардың төмендеуіне және құс шаруашылығының өнімділігінің артуына әкеледі. Антибиотиктерге төзімділіктің таралу механизмдері мен жолдары туралы алынған білім оларды пайдалануды оңтайландыруға көмектеседі, бұл антибиотиктерді сатып алу шығындарын азайтады және төзімділіктің даму қаупін азайтады. Өнім сапасын жақсарту және антибиотиктерді қолдануды азайту нарықтағы өнімді қабылдауды жақсартады, бұл сұраныстың және сәйкесінше кірістің артуына әкелуі мүмкін. не внедрено енгізілген жоқ Использование метода CTAB в сочетании со спин-колонками представляет собой надежный и стандартный подход для выделения ДНК бактерий, и обеспечивает высокую вероятность получения качественных генетических образцов для дальнейшего секвенирования. Анализ полученных данных с помощью программного обеспечения Resistance Gene Identifier – RGI bwt позволяет выявить и предсказать наличие генов, отвечающих за устойчивость к антибиотикам в бактериальном геноме, определить механизм их резистентности. Обучение студентов и молодых ученых современным методам исследования, в том числе включение темы антибиотикорезистентности в образовательные программы Международного инженерно-технологического университета улучшит знания и компетенции будущих специалистов в области здравоохранения и сельского хозяйства. Учитывая все вышеуказанные аспекты, можно заключить, что проект реализуется эффективно. Высокая научная ценность работы обусловлена качественным обоснованием методов, использованием передовых технологий и комплексным подходом к анализу данных. CTAB әдісін спин-бағандармен бірге қолдану бактериялардың ДНҚ-сын оқшаулаудың сенімді және стандартты тәсілі болып табылады және одан әрі секвенирлеу үшін сапалы генетикалық үлгілерді алудың жоғары ықтималдығын қамтамасыз етеді. Resistance Gene Identifier – RGI bwt бағдарламалық құралының көмегімен алынған деректерді талдау бактериялық геномдағы антибиотиктерге төзімділікке жауап беретін гендердің болуын анықтауға және болжауға, олардың төзімділік механизмін анықтауға мүмкіндік береді. Студенттер мен жас ғалымдарды заманауи зерттеу әдістеріне оқыту, соның ішінде халықаралық инженерлік-технологиялық университеттің білім беру бағдарламаларына антибиотикке төзімділік тақырыбын енгізу болашақ денсаулық сақтау және ауыл шаруашылығы мамандарының білімі мен құзыреттілігін жақсартады. Жоғарыда аталған барлық аспектілерді ескере отырып, жоба тиімді жүзеге асырылуда деп қорытынды жасауға болады. Жұмыстың жоғары ғылыми құндылығы әдістердің сапалы негізделуіне, озық технологияларды қолдануға және деректерді талдауға кешенді көзқарасқа байланысты. Данные исследования помогут спрогнозировать и предотвратить эпидемии, связанные с устойчивыми к антибиотикам патогенами. Предприятия, занимающиеся разведением и выращиванием птицы, получат ценные данные о распространении и контроле устойчивых к антибиотикам бактерий, что поможет в повышении продуктивности и безопасности продуктов питания. Государственные и международные организации, ответственные за мониторинг и контроль за общественным здоровьем, могут использовать данные исследования для создания стратегий борьбы с антибиотикорезистентностью и защиты общественного здоровья. Зерттеу деректері антибиотиктерге төзімді қоздырғыштармен байланысты эпидемияларды болжауға және алдын алуға көмектеседі. Құс өсіру және өсіру кәсіпорындары өнімділік пен азық-түлік қауіпсіздігін арттыруға көмектесетін антибиотикке төзімді бактериялардың таралуы мен бақылауы туралы құнды деректер алады. Қоғамдық денсаулықты бақылау мен бақылауға жауапты мемлекеттік және халықаралық ұйымдар зерттеу деректерін антибиотикке төзімділікпен күресу және қоғамдық денсаулықты қорғау стратегияларын жасау үшін пайдалана алады. |
||||
UDC indices | ||||
577.2, 579.64 | ||||
International classifier codes | ||||
34.15.23; 34.15.00; | ||||
Key words in Russian | ||||
бактерии; секвенирование нового поколения; метагеном; эпидемиология; резистом; | ||||
Key words in Kazakh | ||||
бактериялар; жаңа буын секвенциясы; метаген; эпидемиология; қарсы тұру; | ||||
Head of the organization | Сарсенбекова Гульнар Алибековна | Кандидат философских наук / нет | ||
Head of work | Коротецкий Илья Сергеевич | Кандидат биологических наук / Ассоциированный профессор |