Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00585 AP19575049-KC-24 0123РК00085
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 24894509.5 AP19575049
Name of work
Молекулярно-генетические предикторы резистентности Н.pylori к эрадикационным схемам терапии в Республике Казахстан
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Юхневич Екатерина Александровна
0
0
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
Некоммерческое акционерное общество "Карагандинский медицинский университет"
Abbreviated name of the service recipient НАО "Карагандинский медицинский университет"
Abstract

Биоптаты желудка в количестве 100 образцов, H. pylori при обнаружении

100 сынама көлемінде асқазанның биопсиясы, H. pylori анықталған кезде.

Определить региональные генотипы и уровень резистентности к антибактериальным препаратам H. pylori, а также ценность и эффективность молекулярно-генетических методов при диагностике и оценке эрадикационной терапии заболеваний, ассоциированных с H. pylori в Казахстане.

Қазақстандағы H. pylori бактериясымен байланысты аурулардың эрадикациялық терапиясын диагностикалау және бағалау кезінде аймақтық генотиптер мен H. pylori бактерияға қарсы препараттарға төзімділік деңгейін, сондай-ақ молекулалық-генетикалық әдістердің құндылығы мен тиімділігін анықтау.

Дизайн настоящего исследования–проспективное,сравнительное.Методы: Взятие биоптатов слизистой оболочки желудка будет проводится при эндоскопии и исследовании на уреазу врачом эндоскопистом клиники НАО МУК.Далее,образцы немедленно будут доставлены в научно-исследовательскую лабораторию и биоптаты после этапа гомогенизации в 1 мл стерильного физиологического раствора будут засеяны на чашках с Мюллер-Хинтона агаром с добавлением 5% бараньей крови и коммерческой средой.Рост культур будут контролировать на 3,5,7 сутки.После инкубации будет проведена микроскопия по методу Грама и биохимическая идентификация. Окончательная идентификация будет получена с помощью метода MALDI-TOF Biotyper.После чего штаммы будут заморожены при температуре -70°С для дальнейшего молекулярно-генетического исследования.Далее, будет проведено определение чувствительности к антимикробным препаратам Е-тестом.В соответствие с EUCAST(v 11.0) определение чувствительности и интерпретация будет определяться к амоксициллину,кларитромицину,метронидазолу,левофлоксацину,тетрациклину. Следующим этапом будет проводиться молекулярно-генетическое исследование на базе лаборатории TREGENNE.На базе молекулярно-генетической лаборатории будет проводиться выделение ДHK из образцов биопсии, чистых культур патогена по гену ureC. Генотипирование H.pylori будет проведено по генам vacA(s1"/s2, sLa,sLb,s1c,mt/m21),cagA,cagE,iceA(варианты AL n A2) и babA2. Статистический анализ данных будет проведен с помощью программы ANOVA.

Зерттеудің дизайны перспективалы,салыстырмалы.Әдістер: Асқазанның шырышты қабығының биоптаттарын алу эндоскопия және НАО МУК клиникасының эндоскопист дәрігері уреазды зерттеу кезінде жүргізіледі.Әрі қарай, үлгілер дереу ғылыми-зерттеу зертханасына жеткізіледі және биоптаттар 1 мл стерильді тұзды ерітіндідегі гомогенизация кезеңінен кейін 5% қой қаны мен коммерциялық орта қосылған Мюллер-Хинтон агар Петри табақшасында өсіріледі.Дақылдардың өсуі 3,5,7 тәулікке бақыланатын болады.Инкубациядан кейін Грам әдісімен микроскопия және биохимиялық идентификация жүргізіледі. Нақты идентификация MALDI-TOF Biotyper әдісі арқылы алынады.Содан кейін молекулалық-генетикалық зерттеу үшін штамдар -70°C температурада мұздатылады.Әрі қарай, Е-тест арқылы микробқа қарсы препараттарға сезімталдықты анықтау жүргізіледі.EUCAST (v 11.0) сәйкес сезімталдық амоксициллинге, кларитромицинге, метронидазолға, левофлоксацинге,тетрациклинге анықталады. Келесі қадам-TREGENNE зертханасы негізінде молекулалық-генетикалық зерттеу.Молекулалық-генетикалық зертхана негізінде биопсия үлгілерінен, таза ureC гендік патогендік культуралары (glmM) ДНҚ бөлініп алынады. H. pylori генотипі vacA (S1"/S2, SLA,sLb,s1c,mt/M21 нұсқасы),cagA,cagE,iceA(al N A2 нұсқалары) және babA2 гендері бойынша жүзеге асырылады. Деректердің статистикалық талдауы ANOVA бағдарламасының көмегімен жүзеге асырылады.

Распространенность инфекции H. pylori составила 27,64%. В 45,87% случаев встречались эрозивные поражения антрального отдела, язвы желудка (27%) и двенадцатиперстной кишки (27%), связанные с свойствами возбудителя повышенной вирулентности (cagA, vacA). Уровень нечувствительности Н. pylori к кларитромицину (умеренно резистентные и резистентных изоляты) составил 3,57% (МПК50=0,016 мг/л, МПК90=0,15 мг/л); к метронидазолу составил 16,67% (МПК50=0,125 мг/л, МПК90=48 мг/л); к левофлоксацину составил 8,33% (МПК50=0,008 мг/л, МПК90=1 мг/л); к тетрациклину была на уровне 6,17% (МПК50=0,032 мг/л, МПК90=0,75 мг/л); к амоксициклину составил 13,1% (МПК50=0,032 мг/л, МПК90=0,25 мг/л); к нитрофурантоину составил 1,23% (МПК50=0,032 мг/л, МПК90=1 мг/л). По генотипированию образцов ДНК H. рylori по генам:60% изолированных H. рylori были положительных по гену vacA (варианты s1/s2, s1a, s1b, s1c, m1/m2), 40% - cagA, cagE, iceA (варианты А1 и А2) и babA2. Изучение молекулярно-генетических предикторов резистентности H. pylori в центральном регионе Казахстана позволит оптимизировать методы диагностики и оценить эффективность стандартных схем противохеликобактерной терапии. А также, в перспективе решить вопрос о необходимости пересмотра этих схем с учетом локальных данных уровня резистентности и продвигать персонифицированные подходы к фармакотерапии данного заболевания.

H. pylori инфекциясының таралуы 27,64% құрады. Жағдайлардың 45,87% - антральды бөліктің эрозиялық зақымдануы, асқазан жарасы (27%) және он екі елі ішектің (27%) жоғары вируленттілік қоздырғышының (cagA, vacA) қасиеттерімен байланысты.Н. pylori-дің кларитромицинге сезімталдық деңгейі (орташа төзімді және төзімді изоляттар) 3,57% құрады (МПК50=0,016 мг/л, МПК90=0,15 мг/л); метронидазолға 16,67% (МПК50=0,125 мг/л, МПК90=48 мг / л); левофлоксацинге 8,33% құрады (МПК50=0,008 мг/л, МПК90=1 мг/л); тетрациклинге 6,17% деңгейінде болды (МПК50=0,032 мг/л, МПК90=0,75 мг/л); амоксициклинге 13,1% құрады (МПК50=0,032 мг/л, mpc90=0,25 мг/л); нитрофурантоинге 1,23% құрады (МПК50=0,032 мг/л, МПК90=1 мг / л). Гендер бойынша H. pylori ДНҚ үлгілерін генотиптеу бойынша: оқшауланған H. pylori 60% vacA (S1/S2, s1a, s1b, s1c, m1/m2 нұсқалары), 40% - cagA, cagE, iceA (A1 және A2 нұсқалары) және babA2 гендік оң нәтиже көрсетті. Қазақстанның орталық аймағындағы H. pylori резистенттілігінің молекулалық-генетикалық предикторларын зерделеу диагностика әдістерін оңтайландыруға және хеликобактерияға қарсы терапияның стандартты схемаларының тиімділігін бағалауға мүмкіндік береді. Сондай-ақ, келешекте резистенттілік деңгейінің жергілікті деректерін ескере отырып, осы схемаларды қайта қарау қажеттілігі туралы мәселені шешу және осы аурудың фармакотерапиясына дербестендірілген тәсілдерді ілгерілету.

не предусмотрены

қарастырылмаған

не внедрено

енгізілген жоқ

Эффективность проекта будет оценена на 3 году его реализации.

Жоба тиімділігі жобаның 3-ші жылында бағаланады.

Медицина и здравоохранение

Медицина және денсаулық сақтау

UDC indices
615.015.8:616.9-085(574)
International classifier codes
76.00.00;
Key words in Russian
антибиотикорезистентность; Helicobacter pylori; генотип; антибиотик; микробиология;
Key words in Kazakh
антибиотикке төзімділік; Helicobacter pylori; генотип; антибиотик; микробиология;
Head of the organization Турмухамбетова Анар Акылбековна /
Head of work Юхневич Екатерина Александровна PhD / ассоциированный профессор