Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00520 AP23488977-KC-24 0124РК00739
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 33998802 AP23488977
Name of work
Протеотранскриптомный анализ факторов колоректального рака.
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Кулмамбетова Гульмира Нигметжановна
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

объектом исследования являются штамм Fusobacterium nucleatum, и геномная ДНК из ткани кишечника.

Зерттеу нысаны Fusobacterium nucleatum штаммы және ішек тінінен алынған геномдық ДНҚ болып табылады.

Исследование транскриптомного профиля Fusobacterium nucleatum, модулируемого клетками колоректального рака, изучение протеомного профиля ткани толстого кишечника и обсемененности бактерий, ассоциированных с колоректальным раком.

Колоректальды қатерлі ісік жасушаларымен модуляцияланған Fusobacterium nucleatum транскриптомиялық профилін зерттеу, тоқ ішек тінінің протеомдық профилін және колоректальды қатерлі ісікке байланысты бактериялардың таралуын зерттеу.

использовались, микробиологические, молекулярно-генетические методы. Культивирование Fusobacterium nucleatum, экстракция ДНК, кПЦР.

Микробиологиялық және молекулалық-генетикалық әдістер қолданылды. Fusobacterium nucleatum культивациялау, ДНҚ экстракциясы, сПТР.

Был культивирован штамм Fusobacterium nucleatum после крио хранения. F. nucleatum ранее изучен, на основании полногеномного секвенирования, с анализом генов антибиотикорезистентности. Данный штамм изолирован от казахстанского пациента с КРР в нашем предыдущем исследовании. Была изучена обсемененность бактерий, ассоциированных с колоректальным раком. Посредством кПЦР были детектированы бактерии Fusobacterium nucleatum – 37%, Bacteroides fragilis – 40%, Escherichia coli – 67%, Streptococcus gallolyticus – 4%. Анализ ассоциаций распространенности данных бактерий в ткани опухоли по отношению к нормальной здоровой ткани кишечника демонстрирует значимые различия; Fusobacterium P=0,0007, Bacteroides P=0,02, Escherichia P=0,009. Значимых различий в распространенности Streptococcus не выявлено P>0,05. Новизна полученных результатов заключается в выявлении значимых ассоциаций бактерий обитающих в опухоли кишечника по сравнению с нормальной тканью кишечника. Данные получены на казахстанских пациентах с КРР и могут служить для дальнейших исследований в области прогнозирования заболевания и терапии колоректального рака.

Крио сақтаудан кейінгі Fusobacterium nucleatum штаммы культивацияланды. F. nucleatum осыдан алдын толық геномды секвенирлеу және антибиотиктерге төзімділік гендерін талдау негізінде зерттелген. Бұл штамм біздің алдыңғы зерттеуімізде тоқ ішек қатерлі ісігімен ауыратын қазақстандық науқастан бөлініп алынды. Колоректальды қатерлі ісікке байланысты бактериялардың таралуы зерттелді. qPCR көмегімен келесі бактериялар анықталды: Fusobacterium nucleatum - 37%, Bacteroides fragilis - 40%, Escherichia coli - 67%, Streptococcus gallolyticus - 4%. Қалыпты сау ішек тінімен салыстырғанда осы бактериялардың ісік тінінде таралуының ассоциациялық талдауы айтарлықтай айырмашылықтардың барын көрсетеді; Fusobacterium P=0,0007, Bacteroides P=0,02, Escherichia P=0,009. Streptococcus P>0,05 таралуында айтарлықтай айырмашылықтар анықталынбады. Алынған нәтижелердің жаңалығы қалыпты ішек тінімен салыстырғанда ішек ісіктерінде өмір сүретін бактериялардың маңызды ассоциацияларын анықтауда жатыр. Мәліметтер тік ішек обырына шалдыққан қазақстандық пациенттерінен алынған және тоқ ішек обырын емдеу және аурудың болжамы саласындағы одан әрі зерттеулерге өз әсерін береді.

Высоко эффективное детектирование количественных показателей таргета в образце посредством количественной ПЦР.

Сандық ПТР көмегімен үлгідегі нысананың сандық көрсеткіштерін жоғары тиімді анықтау.

не внедрено

Жүзеге асырылмаған

Эффективность проекта определяется дaнными cлужащими ocнoвoй в иccлeдoвaнияx кaнцepoгeнeзa, oбуcлoвлeнныe пpиcутcтвиeм патогенных бактерий, этo пoзвoлит иcпoльзoвaть peзультaты кaк инcтpумeнт для диaгнocтики, пpoгнoзa и кoppeкции тepaпии.

Жобаның тиімділігі патогендік бактериялардың болуынан туындаған канцерогенезді зерттеуге негіз болатын деректермен анықталады, бұл нәтижелерді диагностикалау, болжау және терапияны түзету құралы ретінде пайдалануға мүмкіндік береді.

Цeлeвыми пoтpeбитeлями являютcя cубъeкты биoлoгичecкoгo пpoфиля.

Биологиялық профиль субъектілері мақсатты тұтынушылар болып табылады.

UDC indices
616.33
International classifier codes
76.29.00;
Key words in Russian
Кoлopeктaльный paк; Fusobacterium nucleatum; РНК секвенирование; транскриптомный анализ; протеомный анализ; oнкoлoгия; экспрессия;
Key words in Kazakh
Колоректальды қатерлі ісік; Fusobacterium nucleatum; РНҚ секвенциясы; транскриптомиялық талдау; протеомдық талдау; oнкoлoгия; экспрессия;
Head of the organization Огай Вячеслав Борисович Кандидат биологических наук / Профессор
Head of work Кулмамбетова Гульмира Нигметжановна Phd / нет