Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00977 AP23490016-KC-24 0124РК00847
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 33854634.4 AP23490016
Name of work
Изучение молекулярно-генетических особенностей и мониторинга эффективности терапии медуллобластомы у детей: шаг к персонализированной терапии
Type of work Source of funding Report authors
Applied Баянова Миргуль Файзуллиновна
0
0
2
3
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) НУ
Full name of the service recipient
Корпоративный фонд "University Medical Center" (UMC)
Abbreviated name of the service recipient UMC
Abstract

В рамках ретроспективного исследования предполагается осуществление комплексной диагностики, включающей патоморфологическую, иммуногистохимическую и молекулярно-генетическую оценку имеющихся на момент подачи заявки ФФПБ образцов опухолевой ткани, полученных от пациентов с диагнозом МБ. В проспективном исследовании принимают участие пациенты, не достигшие 18-летнего возраста, у которых гистологически подтвержден диагноз МБ.

Ретроспективті зерттеу шеңберінде МБ диагнозы қойылған пациенттерден алынған, өтінім беру кезінде ффпб бар ісік тінінің үлгілерін патоморфологиялық, иммуногистохимиялық және молекулалық-генетикалық бағалауды қамтитын кешенді диагностиканы жүзеге асыру көзделеді. Перспективалық зерттеуге МБ диагнозы гистологиялық тұрғыдан расталған 18 жасқа толмаған пациенттер қатысады.

Основная цель исследования заключается в изучении молекулярно-генетических особенностей и методов оценки эффективности терапии медуллобластомы у детей, разработке и внедрении алгоритмов диагностики и мониторинга для улучшения персонализированного подхода к ведению педиатрических пациентов с медуллобластомой в Казахстане.

Зерттеудің негізгі мақсаты балалардағы медуллобластома терапиясының тиімділігін бағалаудың молекулалық-генетикалық ерекшеліктері мен әдістерін зерделеу, Қазақстанда медуллобластомасы бар педиатриялық пациенттерді басқарудың дербестендірілген тәсілін жақсарту үшін диагностика және мониторинг алгоритмдерін әзірлеу және енгізу болып табылады.

Ретроспективное исследование будет включать анализ молекулярно-генетических характеристик МБ на основе ФФПБ опухолевых образцов. Предусмотрено проведение дополнительной патоморфологической оценки и иммуногистохимического анализа ФФПБ опухолевых тканей, совместно с Nagasaki University (Япония), в рамках меморандума о научном сотрудничестве. Для изучения генетической этиологии будет выполнена экстракция ДНК из ФФПБ опухолевых образцов, а затем будет проведено полноэкзомное секвенирование с использованием технологии NGS. В рамках проспективного исследования предполагается исследовать применение жидкостной биопсии и доли циркулирующей опухолевой ДНК (цоДНК) для оценки опухолевой гетерогенности и эффективности терапии. В ходе проспективного исследования планируется проведение полноэкзомного секвенирование ФФПБ образцов опухолевой ткани и сцДНК из спинномозговой жидкости (СМЖ), полученной во время резекции опухоли; это позволит изучить молекулярно-генетические особенности МБ, а сопоставление полученных результатов расширит понимание опухолевой гетерогенности. Выявленные онкогенные мутации будут валидированы и мониторированы с помощью аллель-специфической цифровой ПЦР. Полученные результаты позволят внедрить технологию жидкостной биопсии и определения доли цоДНК в качестве метода мониторинга терапии, более того, позволят расширить понимание вопросов опухолевой гетерогенности.

Ретроспективті зерттеу ісік үлгілерінің FFPE негізінде МБ молекулалық-генетикалық сипаттамаларын талдауды қамтиды. Ғылыми ынтымақтастық туралы меморандум шеңберінде Нагасаки университетімен (Жапония) бірлесіп, ісік тіндерінің FFPE қосымша патоморфологиялық бағалау және иммуногистохимиялық талдау жүргізу көзделген. Генетикалық этиологияны зерттеу үшін ісік үлгілерінің FFPE ДНҚ экстракциясы орындалады, содан кейін NGS технологиясын пайдалана отырып, толық экзомды секвенирлеу жүргізіледі. Проспективті зерттеу аясында терапияның ісік гетерогенділігі мен тиімділігін бағалау үшін сұйық биопсияны және айналымдағы ісік ДНҚ-ның (аіДНҚ) үлесін қолдануды зерттеу көзделеді. Проспективті зерттеу барысында ісік резекциясы кезінде алынған цереброспинальды сұйықтықтан (ЖМС) алынған ісік тінінің және аіДНҚ үлгілерінің FFPB толық экзомдық секвенирлеу жүргізу жоспарлануда; бұл МБ молекулалық-генетикалық ерекшеліктерін зерттеуге мүмкіндік береді, ал алынған нәтижелерді салыстыру ісік гетерогенділігі туралы түсінікті кеңейтеді. Анықталған онкогендік мутациялар аллельге тән цифрлық ПТР арқылы тексеріледі және бақыланады. Алынған нәтижелер сұйық биопсия технологиясын енгізуге және терапияны бақылау әдісі ретінде аіДНҚ үлесін анықтауға мүмкіндік береді, сонымен қатар ісік гетерогенділігі мәселелерін түсінуді кеңейтуге мүмкіндік береді.

В рамках проекта впервые начато изучение на территории РК молекулярно-генетический профиля медуллобластомы у детей. Описаны гистологические и иммуногистохимические профили, проведен пересмотр (“второе чтение”) ФФПБ образцов опухолевой ткани с проведением гистологического и иммуногистохимического анализа в ретроспективном и проспективном исследованиях в Nagasaki University (Нагасаки, Япония). Проведена экстракция геномной ДНК из ФФПБ образцов для проведения полноэкзомного секвенирования, и сцДНК из интраоперационного СМЖ материала и плазмы крови для оценки опухолевой гетерогенности и последующего продольного мониторинга доли (концентрации) цоДНК. Это в свою очередь позволит впервые на территории РК провести оценку опухолевой гетерогенности МБ у детей и расширит понимание опухолевой биологии для мировой науки. Определение цоДНК в СМЖ (в рамках планируемого проекта) расширит доказательную базу применения данного подхода, как метода мониторинга и оценки эффективности терапии опухолей ЦНС.

Жоба аясында алғаш рет ҚР аумағында балалардағы медуллобластоманың молекулалық-генетикалық бейінін зерттеу басталды. Гистологиялық және иммуногистохимиялық профильдер сипатталған, Нагасаки университетінде (Нагасаки, Жапония) ретроспективті және проспективті зерттеулерде гистологиялық және иммуногистохимиялық талдау жүргізе отырып, ісік тінінің FFPE үлгілерін қайта қарау ("екінші оқылым") жүргізілді. Толық экзомалды секвенирлеуді жүргізу үшін FFPE үлгілерден геномдық ДНҚ және ісік гетерогенділігін бағалау және кейіннен aіДНҚ үлесінің (концентрациясының) бойлық мониторингі үшін интраоперациялық ЖМС материалы мен қан плазмасынан абДНҚ экстракциясы жүргізілді. Бұл өз кезегінде ҚР аумағында алғаш рет балалардағы МБ ісік гетерогенділігін бағалауға мүмкіндік береді және әлемдік ғылым үшін ісік биологиясын түсінуді кеңейтеді. ЖМС-да (жоспарланған жоба шеңберінде) ОЖЖ ісіктері терапиясының тиімділігін мониторингтеу және бағалау әдісі ретінде осы тәсілді қолданудың дәлелді базасын кеңейтеді.

Внедрение разработанных алгоритмов диагностики и мониторинга позволит снизить затраты на диагностику медуллобластомы за счет точного и раннего выявления риска рецидива. Ожидается сокращение затрат на последующее лечение благодаря улучшенному подходу к персонализированной терапии. Использование молекулярных маркеров для мониторинга рецидива на основе анализа цоДНК в СМЖ позволяет повысить точность диагностики на ранней стадии и снизить число повторных госпитализаций. Также это потенциально поможет избежать ненужных вмешательств и улучшит качество жизни пациентов. Проект впервые проводит исследование генетического профиля и опухолевой гетерогенности медуллобластомы у детей на территории Казахстана, что создает условия для дальнейшего развития онкологии в регионе. Полученные данные могут быть использованы в международных исследованиях и повысить статус Казахстана в научной среде.

Әзірленген диагностикалық және мониторинг алгоритмдерін енгізу рецидив қаупін дәл және ерте анықтау есебінен медуллобластома диагностикасының құнын төмендетуге мүмкіндік береді. Жекелендірілген терапияға жақсарту тәсілдерінің арқасында төменгі ағынды емдеу шығындарының төмендеуі күтілуде. ЖМС-ғы аіДНҚ талдауы негізінде қайталануды бақылау үшін молекулярлық маркерлерді пайдалану ерте диагностиканың дәлдігін жақсартуға және қайта қабылдау санын азайтуға мүмкіндік береді. Бұл сонымен қатар қажетсіз араласудан аулақ болуға және пациенттердің өмір сапасын жақсартуға көмектеседі. Жоба алғаш рет Қазақстандағы балалардағы медуллобластоманың генетикалық профилі мен ісіктерінің гетерогенділігіне зерттеу жүргізіп отыр, бұл өңірде онкологияның одан әрі дамуына жағдай жасайды. Алынған мәліметтерді халықаралық зерттеулерде қолдануға және Қазақстанның ғылыми ортадағы мәртебесін көтеруге болады.

Результаты проекта будут использованы для разработки программы комплексной ранней оценки риска рецидива МБ у детей и будут использованы детскими онкологами-гематологами для улучшения ведения пациентов с МБ в Казахстане.

Жобаның нәтижелері балалардағы МБ қайталану қаупін кешенді ерте бағалау бағдарламасын әзірлеу үшін пайдаланылатын болады және Қазақстанда МБ бар пациенттерді жүргізуді жақсарту үшін балалар онколог-гематологтары пайдаланатын болады.

UDC indices
76.29.49
International classifier codes
76.29.49;
Key words in Russian
Медуллобластома; Детский возраст; Молекулярно-генетическая диагностика; Полноэкзомное секвенирование; Цифровая ПЦР; Жидкостная биопсия; цоДНК;
Key words in Kazakh
Медуллобластома; Балалық шақ; Молекулалық-генетикалық диагностика; Толық экзомды секвенирлеу; Сандық ПТР; Сұйық биопсия; аіДНҚ;
Head of the organization Пя Юрий Владимирович Доктор медицинских наук / Ассоциированный профессор
Head of work Баянова Миргуль Файзуллиновна Кандидат медицинских наук / нет