The object of research, development or design (in Russian) : Объектами исследований являются Вирусы гриппа птиц и болезни Ньюкасла

The object of research, development or design (in Kazakh) : Зерттеу объектілері құс тұмауы және Ньюкасл ауруы вирустары болып табылады

Aim of work (in Russian) : Целью данного проекта является проведение комплексных мероприятий, нацеленных на проведение эпидемиологического мониторинга острых вирусных заболеваний как высокопатогенный грипп птиц (ГП) и Болезнь Ньюкасла (БН) на территории Казахстана, а также разработка мультиплексного ПЦР Реал-Тайм для их диагностики, с последующим изучением молекулярно-биологических свойств и депонированием выделенных штаммов.

Aim of work (in Kazakh) : Бұл жобаның мақсаты – Қазақстанда жоғары патогенді құс тұмауы (HPAI) және Ньюкасл ауруы (ND) сияқты жіті вирустық аурулардың эпидемиологиялық мониторингін жүргізуге бағытталған кешенді іс-шараларды жүзеге асыру, сондай-ақ нақты уақыт режимінде мультиплексті ПТР әзірлеу. олардың диагностикасы үшін, содан кейін молекулалық биологиялық қасиеттерін зерттеу және оқшауланған штаммдардың тұндыру.

Методы исследования (на русском) : Исследования проводятся с использованием методов генной инженерии и молекулярной биологии. В НИИПББ представляет практику исследования инфекционных патогенов от первоначальной диагностики и идентификации до выделения патогена с последующей молекулярно-биологической характеристикой с использованием электронной микроскопии, ПЦР в реальном времени и секвенирования (Sanger, NGS, Illumina). Все исследовательские работы, выполняемые в ходе реализации проекта состоят из 8 (восьми) основных этапов: • Разработка мультиплексного ПЦР Реал-Тайм для диагностики вирусов ГП и БН. • Эпидемиологический мониторинг и отбор проб; • Электронная микроскопия вирусов; • Идентификация методом ОТ- ПЦР; • Выделение изолятов, изучение биологических свойств вирусов; • Депонирование штаммов в «Коллекцию микроорганизмов» НИИПББ; • Секвенирование значимых генов вирусов (гемагглютинин, нейраминидаза, матриксный белок, нуклеопротеид, F-фьюжн белок, белок VP2 ); • Сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидной последовательности генов; • Загрузка полногеномной нуклеотидной последовательности в базу данных GenBank и оформление публикация отечественных и зарубежных статей, тезисов и патентов.

Методы исследования (на казахском) : Зерттеулер гендік инженерия және молекулалық биология әдістерін қолдану арқылы жүргізіледі. БҚПҒЗИ жұқпалы қоздырғыштарды бастапқы диагностикадан және анықтаудан бастап патогенді оқшаулауға дейін электронды микроскопия, нақты уақыт режимінде ПТР және секвенирлеу (Sanger, NGS, Illumina) арқылы кейінгі молекулалық биологиялық сипаттамаға дейін зерттеу тәжірибесін білдіреді. Жоба барысында жүргізілетін барлық зерттеу жұмыстары 8 (сегіз) негізгі кезеңнен тұрады: • HP және BN вирустарын диагностикалау үшін нақты уақыттағы мультиплексті ПТР әзірлеу. • Эпидемиологиялық мониторинг және сынама алу; • Вирустардың электронды микроскопиясы; • RT-ПТР әдісімен сәйкестендіру; • Изоляттарды бөліп алу, вирустардың биологиялық қасиеттерін зерттеу; • Биоорганизмдер ғылыми-зерттеу институтының «Микроорганизмдер коллекциясында» штамдарды қою; • Маңызды вирустық гендердің секвенирленуі (гемагглютинин, нейраминидаза, матрицалық ақуыз, нуклеопротеин, F-фузия ақуызы, VP2 ақуызы); • Гендердің нуклеотидтер тізбегін салыстырмалы және филогенетикалық талдау; • GenBank дерекқорына толық геномдық нуклеотидтер тізбегін жүктеу және отандық және шетелдік мақалаларды, тезистерді және патенттерді жариялауды өңдеу.

Obtained results and novelty (in Russian) : - Определена специфичность ОТ-ПЦР РВ тест-системы с применением РНК вирусов ГП, БН, инфекционного бурсита кур, инфекционного бронхита птиц. - Определена аналитическая чувствительность мультиплексной ОТ-ПЦР РВ тест-системы для диагностики вирусов ГП и БН, которая составила порядка 10 копий молекул РНК в одной реакции. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система для диагностики вирусов ГП и БН успешно прошла валидацию по параметрам специфичности и чувствительности на образцах РНК вирусов ГП и БН с применением коммерческих тест-систем. Исследования показали, что разработанная тест-система по параметрам специфичности и чувствительности работает одинаково относительно коммерческих наборов. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система проверена на клинических образцах диких и домашних птиц, где показала свою высокую эффективность, специфичность, и достоверность полученных данных. Также произведена оптимизация состава реакционной смеси для исследования клинических образцов. - Согласно запланированным задачам был проведен мониторинг болезней птиц на территории Казахстана, именно Жамбылская и Туркестанская области. Образцы отбирались от диких перелетных птиц, различных видов согласно рекомендациям МЭБ. - Проведено секвенирование поверхностных генов (HA и NA ) вируса гриппа. По полученным данным проведен филогенетический анализ нуклеотидной последовательности.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : - HP, BN, жұқпалы тауық бурситі, құстардың инфекциялық бронхиті РНҚ вирустарын қолданатын RT-PCR RT тест жүйесінің ерекшелігі анықталды. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесінің аналитикалық сезімталдығы анықталды, ол бір реакцияда РНҚ молекулаларының шамамен 10 көшірмесін құрады. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі коммерциялық сынақ жүйелерін пайдалана отырып, HP және BN вирустарының РНҚ үлгілеріндегі спецификалық және сезімталдық тұрғысынан сәтті расталды. Зерттеулер көрсеткендей, әзірленген тест жүйесі коммерциялық жинақтармен салыстырғанда ерекшелік пен сезімталдық жағынан бірдей орындалады. - Әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі жабайы және үй құстарының клиникалық үлгілеріне сынақтан өтті, мұнда ол өзінің жоғары тиімділігін, ерекшелігін және алынған мәліметтердің сенімділігін көрсетті. Реакциялық қоспаның құрамы да клиникалық үлгілерді зерттеу үшін оңтайландырылған. – Жоспарлы тапсырмаларға сәйкес Қазақстан аумағында, атап айтқанда Жамбыл және Түркістан облыстарында құс ауруларына мониторинг жүргізілді. Үлгілер ХЭБ ұсыныстарына сәйкес әртүрлі түрдегі жабайы қоныс аударатын құстардан алынды. - тұмау вирусының беткі гендерін (HA және NA) секвенирлеу жүргізілді. Алынған мәліметтер негізінде нуклеотидтер тізбегіне филогенетикалық талдау жүргізілді.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Определена специфичность ОТ-ПЦР РВ тест-системы с применением РНК вирусов ГП, БН, инфекционного бурсита кур, инфекционного бронхита птиц. - Определена аналитическая чувствительность мультиплексной ОТ-ПЦР РВ тест-системы для диагностики вирусов ГП и БН, которая составила порядка 10 копий молекул РНК в одной реакции. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система для диагностики вирусов ГП и БН успешно прошла валидацию по параметрам специфичности и чувствительности на образцах РНК вирусов ГП и БН с применением коммерческих тест-систем. Исследования показали, что разработанная тест-система по параметрам специфичности и чувствительности работает одинаково относительно коммерческих наборов. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система проверена на клинических образцах диких и домашних птиц, где показала свою высокую эффективность, специфичность, и достоверность полученных данных. Также произведена оптимизация состава реакционной смеси для исследования клинических образцов. - Согласно запланированным задачам был проведен мониторинг болезней птиц на территории Казахстана, именно Жамбылская и Туркестанская области. Образцы отбирались от диких перелетных птиц, различных видов согласно рекомендациям МЭБ. - Проведено секвенирование поверхностных генов (HA и NA ) вируса гриппа. По полученным данным проведен филогенетический анализ нуклеотидной последовательности.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : - HP, BN, жұқпалы тауық бурситі, құстардың инфекциялық бронхиті РНҚ вирустарын қолданатын RT-PCR RT тест жүйесінің ерекшелігі анықталды. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесінің аналитикалық сезімталдығы анықталды, ол бір реакцияда РНҚ молекулаларының шамамен 10 көшірмесін құрады. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі коммерциялық сынақ жүйелерін пайдалана отырып, HP және BN вирустарының РНҚ үлгілеріндегі спецификалық және сезімталдық тұрғысынан сәтті расталды. Зерттеулер көрсеткендей, әзірленген тест жүйесі коммерциялық жинақтармен салыстырғанда ерекшелік пен сезімталдық жағынан бірдей орындалады. - Әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі жабайы және үй құстарының клиникалық үлгілеріне сынақтан өтті, мұнда ол өзінің жоғары тиімділігін, ерекшелігін және алынған мәліметтердің сенімділігін көрсетті. Реакциялық қоспаның құрамы да клиникалық үлгілерді зерттеу үшін оңтайландырылған. – Жоспарлы тапсырмаларға сәйкес Қазақстан аумағында, атап айтқанда Жамбыл және Түркістан облыстарында құс ауруларына мониторинг жүргізілді. Үлгілер ХЭБ ұсыныстарына сәйкес әртүрлі түрдегі жабайы қоныс аударатын құстардан алынды. - тұмау вирусының беткі гендерін (HA және NA) секвенирлеу жүргізілді. Алынған мәліметтер негізінде нуклеотидтер тізбегіне филогенетикалық талдау жүргізілді.

Level of implementation (in Russian) : Не внедрено

Level of implementation (in Kazakh) : Еңгізілмеген

Efficiency (in Russian) : - Определена специфичность ОТ-ПЦР РВ тест-системы с применением РНК вирусов ГП, БН, инфекционного бурсита кур, инфекционного бронхита птиц. - Определена аналитическая чувствительность мультиплексной ОТ-ПЦР РВ тест-системы для диагностики вирусов ГП и БН, которая составила порядка 10 копий молекул РНК в одной реакции. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система для диагностики вирусов ГП и БН успешно прошла валидацию по параметрам специфичности и чувствительности на образцах РНК вирусов ГП и БН с применением коммерческих тест-систем. Исследования показали, что разработанная тест-система по параметрам специфичности и чувствительности работает одинаково относительно коммерческих наборов. - Разработанная мультиплексная ОТ-ПЦР РВ тест-система проверена на клинических образцах диких и домашних птиц, где показала свою высокую эффективность, специфичность, и достоверность полученных данных. Также произведена оптимизация состава реакционной смеси для исследования клинических образцов. - Согласно запланированным задачам был проведен мониторинг болезней птиц на территории Казахстана, именно Жамбылская и Туркестанская области. Образцы отбирались от диких перелетных птиц, различных видов согласно рекомендациям МЭБ. - Доставленные образцы от диких птиц были исследованы методом ОТ-ПЦР, где положительные пробы были направлены на дальнейшее вирусовыделение с использованием Развивающихся Куриных Эмбрионов.

Efficiency (in Kazakh) : - HP, BN, жұқпалы тауық бурситі, құстардың инфекциялық бронхиті РНҚ вирустарын қолданатын RT-PCR RT тест жүйесінің ерекшелігі анықталды. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесінің аналитикалық сезімталдығы анықталды, ол бір реакцияда РНҚ молекулаларының шамамен 10 көшірмесін құрады. - HP және BN вирустарын диагностикалау үшін әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі коммерциялық сынақ жүйелерін пайдалана отырып, HP және BN вирустарының РНҚ үлгілеріндегі спецификалық және сезімталдық тұрғысынан сәтті расталды. Зерттеулер көрсеткендей, әзірленген тест жүйесі коммерциялық жинақтармен салыстырғанда ерекшелік пен сезімталдық жағынан бірдей орындалады. - Әзірленген мультиплексті RT-PCR RT тест жүйесі жабайы және үй құстарының клиникалық үлгілеріне сынақтан өтті, мұнда ол өзінің жоғары тиімділігін, ерекшелігін және алынған мәліметтердің сенімділігін көрсетті. Реакциялық қоспаның құрамы да клиникалық үлгілерді зерттеу үшін оңтайландырылған. – Жоспарлы тапсырмаларға сәйкес Қазақстан аумағында, атап айтқанда Жамбыл және Түркістан облыстарында құс ауруларына мониторинг жүргізілді. Үлгілер ХЭБ ұсыныстарына сәйкес әртүрлі түрдегі жабайы қоныс аударатын құстардан алынды. - Жабайы құстардан жеткізілген үлгілер RT-ПТР әдісімен сыналды, онда оң үлгілер дамушы тауық эмбриондарын қолдану арқылы әрі қарай вирусты оқшаулауға жіберілді.

Field of application (in Russian) : Результаты исследований могут быть использованы в области обеспечения биологической безопасности животного разнообразия (дикие и домашние птицы)

Field of application (in Kazakh) : Зерттеу нәтижелері жануарлардың әртүрлілігінің (жабайы және құс) биологиялық қауіпсіздігін қамтамасыз ету саласында қолданылуы мүмкін.