Inventory number IRN Number of state registration
0219РК00623 BR05236574-OT-19 0118РК00934
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Промежуточный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 3 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 3 31
Total number of pages Patents Illustrations
46 0 7
Amount of funding Code of the program Table
19000 О.0798 9
Code of the program's task under which the job is done
03
Name of work
Исследование активности мобильных элементов в геноме злаков, связанных с гетерозисом и стрессоустойчивостью
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Applied research Метод, способ
Report authors
Календарь Руслан Николаевич , Данияров Асет Жанатович , Шевцов Владислав Александрович ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объектами исследования являлись линии злаковых культур Lolium perenne L., Festuca pratensis и Festulolium loliaceum, полученная при межвидовой гибридизации.

Зерттеу нысандары Lolium perenne L., Festuca pratensis және олардың аралық буданы - Festulolium loliaceum.

Цель работы - формирование коллекции генетического материала злаковых культур, полученных при межвидовой гибридизации; провести анализ генома Lolium perenne L.; изучение количественной экспрессии мобильных элементов на абиотический стресс и провести IRAP анализ ДНК образцов злаковых культур Lolium perenne L., Festuca pratensis и Festulolium loliaceum.

Жоба мақсаты - аралық будандастыру арқылы алынған дәнді дақылдардың генетикалық материалдарының коллекциясын қалыптастыру; Lolium perenne L. геномын талдаңыз; Абиотикалық күйзеліске арналған жылжымалы элементтердің сандық көрінісін зерттеп, Lolium perenne L., Festuca pratensis және Festulolium loliaceum дәнді дақылдар үлгілеріне ДНҚ-ға IRAP-анализін орындау.

Методы исследования: молекулярной и клеточной биологии, биоинформатики: геномный анализ, сравнительный анализ последовательностей ДНК, множественное выравнивание последовательностей ДНК, подбор ПЦР праймеров, выделения ДНК/РНК, ПЦР скрининг.

Зерттеу әдістері: молекулярлық және жасушалық биология; биоинформатика: геномдық талдау, ДНҚ тізбегін салыстырмалы талдау, ДНҚ тізбегін бірнеше рет туралау, ПТР праймерлерін таңдау, ДНҚ / РНҚ оқшаулау, ПТР скрининг.

В результате исследования сформирована коллекция генетического материала злаковых культур, полученных при межвидовой гибридизации. Сформирована ДНК- и РНК-коллекция злаковых культур, полученных при межвидовой гибридизации. Проведён биоинформационный анализ нуклеотидных последовательностей высококопийных LTR-ретротранспозонов для генома Lolium perenne L. Разработаны ПЦР праймеры для детекции мобильных элементов из генома Lolium perenne. Проведен IRAP анализ ДНК образцов злаковых культур Lolium perenne L., Festuca pratensis и Festulolium loliaceum. Проведён количественный анализ экспрессии мобильных элементов в стрессовых условиях по сравнению со стандартными условия культивирования в исследованиях ОТ-кПЦР для образцов (Lolium perenne, Festuca pratensis и Festulolium). Последовательности рибосомальных генов рРНК для некоторых растительных видов были размещены в Генбанке NCBI под номерами: MK050854-MK049257, MH500772-MH500773, а также последовательности генов Vrn: MK007525, MK240190-MK240221, и гена acetyl-CoA carboxylase beta subunit (accD): MK619486-MK61967, и гена biotin carboxyl carrier protein (bccp): MK644626-MK644819.

Зерттеу нәтижесінде дәнді дақылдардың тұқым қуалайтын тұқым қуалайтын материалдарының коллекциясы құрылды. Түрлі будандастыру арқылы алынған ДНҚ және РНҚ жиынтығы. Lolium perenne L геномы үшін жоғары көшірмелі LTR ретротранспозондарының нуклеотидтер тізбегіне биоинформациялық талдау жүргізілді, Lolium perenne геномынан жылжымалы элементтерді анықтау үшін ПТР праймерлері жасалды. Lolium perenne L., Festuca pratensis және Festulolium loliaceum дәнді дақылдарының ДНҚ үлгілеріне IRAP-талдау жасалды. Үлгілерді (Lolium perenne, Festuca pratensis және Festulolium) зерттеу үшін ОТ-кПЦР зерттеулерінде стандартты өсіру жағдайымен салыстырғанда, стресстік жағдайларда жылжымалы элементтердің өрнегіне сандық талдау жүргізілді. Кейбір өсімдіктердің түрлері үшін рибосомалық рРНК гендерінің тізбектері ГенБанк NCBI-дан MK050854-MK049257, MH500772-MH500773, сонымен қатар Vrn гендерінің тізбегі: MK007525, MK240190-MK240221, және acetyl-CoA carboxylase beta subunit (accD): MK619486-MK61967, biotin carboxyl carrier protein (bccp): MK644626-MK644819 сандарымен орналастырылды.

В качестве основного оборудования использовали спектрофотометр, бидистиллятор, ламинары, холодильники, термостаты, оборудование для ПЦР, центрифуги, сушильные шкафы, микроскопы, весы, автоклав, магнитные мешалки, рН-метр, камеры для электрофореза, гельдокументирующая система, компьютер.

Пайдаланылған негізгі жабдық спектрофотометр, қос дистиллятор, ламинар, тоңазытқыш, термостат, ПЦР үшін жабдықтар, центрифугалар, кептіру шкафтары, микроскоптар, таразы, автоклав, магниттік араластырғыштар, рН метрі, электрофорез камералары, гельді құжаттау жүйесі, компьютер.

Область применения: биотехнология.

Қолдану аясы: биотехнология.

UDC indices
633.1, 57.045, 57.088, 577.2
International classifier codes
34.03.23; 34.31.15;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ; БИОИНФОРМАТИКА; МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ; СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ; Гетерозис;
Key words in Kazakh
МОЛЕКУЛАЛЫҚ БИОЛОГИЯ; БИОИНФОРМАТИКА; МОБИЛЬДІК ЭЛЕМЕНТТЕР; СТРЕССКЕ ТӨЗІМДІЛІК; Гетерозис;
Head of the organization Раманкулов Ерлан Мирхайдарович Phd / Профессор
Head of work Календарь Руслан Николаевич Кандидат биологических наук / Профессор
Native executive in charge Данияров Асет Жанатович магистр технических наук