Inventory number IRN Number of state registration
0324РК00413 AP19678106-KC-24 0123РК00754
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Patents Amount of funding Code of the program
0 35376880.8 AP19678106
Name of work
Выявление новых герминальных и соматических мутаций при интракраниальных артериовенозных мальформациях
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Жолдыбаева Елена Витальевна
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

ДНК и РНК выделенные из крови и тканей головного мозга от пациентов с диагнозом АВМ

АВМ диагнозы бар науқастардан қан мен ми тінінен бөлінген ДНҚ және РНҚ

Цель проекта заключается в идентификации новых и редких герминальных и соматических мутаций, обуславливающие развитие АВМ головного мозга; выявление ключевых генов и биологических путей, участвующих в прогрессировании АВМ головного мозга на основе РНК-секвенирования.

Жобаның мақсаты – мидың АВМ дамуын тудыратын жаңа және сирек кездесетін герминальды және соматикалық мутацияларды анықтау; РНҚ секвенциясы негізінде ми АВМ прогрессиясына қатысатын негізгі гендер мен биологиялық жолдарды анықтау.

Молекулярно-генетические (NGS cеквенировнаие и секвенирование по Сенгеру)

Молекулалық генетика (NGS секвенциясы және Сэнгер секвенциясы)

За текущий 2024 год сформирована выборка из пациентов с верифицированным диагнозом АВМ головного мозга ( кровь и ткань). Из собранных образцов выделена ДНК/РНК, также сформированы архивные коллекции нуклеиновых кислот с количественными характеристиками. Проведено полноэкзомное секвенирование образцов (14 образцов). Проведен биоинформатический анализ полученных данных. В результате биоинформатического анализа в исследуемых образцах было выявлено порядка от 3-6 генов-кандидатов, которые могут влиять на патогенез АВМ головного мозга. Выбранные кандидатные генетические варианты в генах были проверены ДНК секвенированием по Сэнгеру. Проведено РНК-секвенировнаия образцов крови и тканей пораженных АВМ от одного и того же пациента (18 образцов).с использованием платформы DNBSEQ со средним выходом 8,51 ГБ данных на образец. Средний коэффициент выравнивания генома сравнения образца составил 97,68%, что является допустиммым Среднее выравнивание набора генов составило 53,76%; всего обнаружено порядка 123252. Анализ полученных данных был проведен с помощью программы Dr.Tom systems support (https://www.bgi.com/global/service/dr-tom). Для проверки данных транскриптома пять DEG были выбраны случайным образом. Валидацию проводили методом количественного анализа ПЦР в реальном времени (qRT-PCR) с использованием флуоресцентного красителя SYBR Green I.

Ағымдағы жыл ішінде бас миының АВМ (қан және тін) тексерілген диагнозы бар науқастардың үлгісі қалыптастырылды. Жиналған үлгілерден ДНҚ/РНҚ бөлініп, сандық сипаттамалары бар нуклеин қышқылдарының мұрағаттық коллекциялары да қалыптасты. Үлгілердің толық экзомалық реттілігі (18 үлгі) орындалды. Алынған мәліметтерге биоинформатикалық талдау жүргізілді. Алынған мәліметтерге биоинформатикалық талдау жүргізілді. Биоинформатикалық талдау нәтижесінде зерттелген үлгілерде мидың АВМ патогенезіне әсер етуі мүмкін шамамен 3-6 кандидат гендер анықталды. Гендердегі таңдалған кандидаттық генетикалық нұсқалар ДНҚ Сэнгер секвенциясы арқылы тексерілді. Бір емделушіден (18 үлгі) зардап шеккен АВМ үлгілерінің қан және тін үлгілерінің РНҚ-тізбегі бір үлгіге 8,51 ГБ деректердің орташа шығысы бар DNBSEQ платформасы арқылы жүзеге асырылды. Салыстыру үлгісінің орташа геномдық теңестіру коэффициенті 97,68% болды, бұл қолайлы гендердің орташа туралануы 53,76% болды; барлығы шамамен 123252 анықталды. Алынған деректерді талдау Dr.Tom жүйелерін қолдау бағдарламасы (https://www.bgi.com/global/service/dr-tom) арқылы жүзеге асырылды. Транскриптомдық деректерді тексеру үшін бес DEG кездейсоқ таңдалды. Валидация SYBR Green I флуоресцентті бояғышын пайдаланып нақты уақыт режиміндегі ПТР (qRT-PCR) сандық талдауы арқылы орындалды.

данный проект направлен на развитие персонализированной медицины, досимптомной диагностики и определение групп риска пациентов с предрасположенностью развития АВМ головного мозга c целью оценки прогноза и возможных осложнений, что в последующем послужит основой создания протоколов для активного профилактического лечения, своевременного проведения адекватной симптоматической терапии. Понимание молекулярных процессов актуально для разработок таргетной терапии.

Бұл жоба жекелендірілген медицинаны дамытуға, симптоматикалық диагностикаға және болжамды және ықтимал асқынуларды бағалау үшін мидың АВМ дамуына бейімділігі бар науқастардың қауіп топтарын анықтауға бағытталған, олар кейіннен емдеуге негіз болады. белсенді профилактикалық емдеу хаттамаларын құру, адекватты симптоматикалық терапияны уақтылы жүргізу. Мақсатты терапияны дамыту үшін молекулалық процестерді түсіну маңызды.

В настоящее время внедрение отсутствует, так как проект представляет 2 год выполнения.

Бұл жоба жекелендірілген медицинаны дамытуға, симптоматикалық диагностикаға және болжамды және ықтимал асқынуларды бағалау үшін мидың АВМ дамуына бейімділігі бар науқастардың қауіп топтарын анықтауға бағытталған, олар кейіннен емдеуге негіз болады. белсенді профилактикалық емдеу хаттамаларын құру, адекватты симптоматикалық терапияны уақтылы жүргізу. Мақсатты терапияны дамыту үшін молекулалық процестерді түсіну маңызды.

Будет получена допонительная информация о мутациях и генах , кoтopыe нe были oпиcаны pаннee, чтo pаcшиpит понимание пaтoгeнeтичeских мeхaнизмoв рaзвития зaбoлeвaния, что в свою очередь позволит использовать результаты как инстурмент для диагностикив области персонализированной медицины (определение групп риска), и способствоать разработкам таргетной терапии с целью предотвращения разрыром АВМ голвного мозгка и кровоизилиянию.

Бұрын сипатталмаған мутациялар мен гендер туралы қосымша ақпарат алынады, бұл аурудың дамуының патогенетикалық механизмдері туралы түсінікті кеңейтеді, бұл өз кезегінде нәтижелерді дербестендірілген медицина саласында диагностикалық құрал ретінде пайдалануға мүмкіндік береді ( тәуекел топтарын анықтау) және мидың AVM жыртылуы мен қан кетуінің алдын алу үшін мақсатты терапияны дамытуға ықпал етеді.

Проект является фундаментальным, однако, полученные результаты в рамках проекта позволят расширить понимание о патогенезе данного заболевания, что является актуальным для разработок в области таргентой терапии и развитии персонализированной медицины при данном заболевании

Жоба іргелі болып табылады, дегенмен жоба аясында алынған нәтижелер осы аурудың патогенезі туралы түсінікті кеңейтеді, бұл мақсатты терапия саласындағы әзірлемелер және осы ауруға арналған жеке медицинаны дамыту үшін өзекті болып табылады.

UDC indices
616-092:577.2
International classifier codes
34.23.35; 34.23.53; 34.15.23; 76.03.39;
Key words in Russian
АВМ головного мозга; патогенные варианты; экзом; секвенирование; молекулярная сигнализация;
Key words in Kazakh
ми АВМ; патогендік нұсқалар; экзом; секвенирлеу; молекулалық сигнализация;
Head of the organization Жумабекова Марал Бапановна к.х.н. /
Head of work Жолдыбаева Елена Витальевна Кандидат биологических наук / ассоциированный профессор