Inventory number | IRN | Number of state registration |
---|---|---|
0224РК00054 | AP14869076-OT-24 | 0122РК00540 |
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation |
Заключительный | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
Publications | ||
Native publications: 0 | ||
International publications: 2 | Publications Web of science: 1 | Publications Scopus: 2 |
Number of books | Appendicies | Sources |
1 | 3 | 18 |
Total number of pages | Patents | Illustrations |
71 | 1 | 3 |
Amount of funding | Code of the program | Table |
32077110.7 | AP14869076 | 1 |
Name of work | ||
Влияние мобильных генетических элементов на эволюцию генома человека | ||
Report title | ||
Type of work | Source of funding | The product offerred for implementation |
Fundamental | Метод, способ | |
Report authors | ||
Календарь Руслан Николаевич , Каиров Улыкбек Еруланович , | ||
0
0
0
0
|
||
Customer | МНВО РК | |
Information on the executing organization | ||
Short name of the ministry (establishment) | Нет | |
Full name of the service recipient | ||
Частное учреждение "National Laboratory Astana" | ||
Abbreviated name of the service recipient | National Laboratory Astana | |
Abstract | ||
человек, геном человека, эндогенные вирусы и мобильные элементы адам, адам геномы, эндогендік вирустар және қозғалмалы элементтер является изучение потенциальной роли различных мобильных элементов и эндогенных ретровирусов в клеточной (геномной) адаптации, их взаимосвязь со здоровьем и болезнями человека. жасушалық бейімделумен және адам денсаулығы мен ауруларымен байланысты әртүрлі транспозиционды элементтердің және эндогендік ретровирустарды енгізу оқиғаларының әлеуетті рөлін зерттеу. материалами исследования являются данные полногеномного секвенирования 500 преимущественно здоровых людей, набранных из Европы и Азии. Биоинформационные методы, для анализа данных длинных чтений, полученных с помощью нанопорового секвенирования ONT, с использованием машинного обучения. Зерттеу материалдары Еуропа мен Азиядан алынған, негізінен сау 500 адамның тұтас геномдық секвенирлеу деректері болып табылады. Машиналық оқытуды пайдалана отырып, нанопора ONT реттілігінен ұзақ оқылатын деректерді талдаудың биоинформатика әдістері. Научная новизна данного проекта заключается в том, будет впервые изучена роль мобильных генетических элементов и эндогенных ретровирусов в формировании дифференциации человеческих популяций и генетических изменений, как один из ключевых факторов эволюции генома и генетической. Выполнена разработка универсального биоинформатического конвейера для анализа геномных последовательностей человека, полученных нанопоровым секвенированием, чтобы установить эволюционную и потенциальную роль мобильных генетических элементов и эндогенных ретровирусов, связанных эволюцией человека, со здоровьем и наследственными болезнями человека. Бұл жобаның ғылыми жаңалығы геномдық және генетикалық эволюцияның негізгі факторларының бірі ретінде алғаш рет жылжымалы генетикалық элементтер мен эндогендік ретровирустардың адам популяцияларының дифференциациясын және генетикалық өзгерістерін қалыптастырудағы рөлін анықтауда. оқыды. Адам эволюциясымен және адам денсаулығымен және тұқым қуалайтын аурулармен байланысты жылжымалы генетикалық элементтер мен эндогендік ретровирустардың эволюциялық және әлеуетті рөлін анықтау мақсатында нанопораларды секвенирлеу арқылы алынған адамның геномдық тізбектерін талдау үшін әмбебап биоинформатика құбыры әзірленді. Выполнена разработка универсальной биоинформатической программы для анализа геномных последовательностей человека, чтобы установить эволюционную и потенциальную роль мобильных генетических элементов и эндогенных ретровирусов, связанных эволюцией человека, со здоровьем и наследственными болезнями человека. Опубликованы статьи в рецензируемых научных изданиях, входящих в Q1-Q2 квартили в базе Web of Science и имеющих процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 50. Адамның геномдық тізбектерін талдауға арналған әмбебап биоинформатика бағдарламасын әзірлеу адам эволюциясымен, адам денсаулығымен және тұқым қуалайтын аурулармен байланысты жылжымалы генетикалық элементтер мен эндогендік ретровирустардың эволюциялық және әлеуетті рөлін анықтау мақсатында жүзеге асырылды. Мақалалар Web of Science мәліметтер базасындағы Q1-Q2 квартиліне кіретін және Scopus мәліметтер базасында CiteScore пайыздық көрсеткіші кемінде 50 болатын рецензияланған ғылыми журналдарда жарияланды. Разработана универсальная биоинформатическая программа для анализа генома человека, которая может использоваться исследовательскими учреждениями и организациями общественного здравоохранения. Программа позволяет автоматизировать процесс анализа мобильных генетических элементов и эндогенных ретровирусов, обеспечивая высокую воспроизводимость и точность данных. Потенциальное внедрение данной программы возможно в клинических и исследовательских центрах для прогнозирования генетических изменений и их влияния на здоровье человека. Адам геномын талдауға арналған әмбебап биоинформатика бағдарламасы әзірленді, оны ғылыми-зерттеу мекемелері мен денсаулық сақтау ұйымдары пайдалана алады. Бағдарлама мобильді генетикалық элементтер мен эндогендік ретровирустарды талдау процесін автоматтандыруға мүмкіндік береді, деректердің жоғары қайталануы мен дәлдігін қамтамасыз етеді. Бұл бағдарламаны әлеуетті іске асыру генетикалық өзгерістер мен олардың адам денсаулығына әсерін болжау үшін клиникалық және ғылыми орталықтарда мүмкін. Созданный биоинформатическая программа демонстрирует высокую эффективность в анализе геномных данных, позволяя осуществлять быстрый и детальный анализ мобильных генетических элементов и эндогенных ретровирусов. Это способствует глубокому пониманию их роли в эволюции человека, генетическом разнообразии, а также их влиянии на здоровье и наследственные заболевания. Методы машинного обучения, интегрированные в конвейер, позволяют автоматизировать и улучшить точность анализа, а также сделать его адаптируемым к различным популяциям и типам данных, что обеспечивает широкие возможности для научных исследований и практического применения. Программа размещена на репозитории GitHunb: https://github.com/rkalendar/Repeater https://github.com/rkalendar/TotalRepeats Құрылған биоинформатика бағдарламасы жылжымалы генетикалық элементтер мен эндогендік ретровирустарды жылдам және егжей-тегжейлі талдауға мүмкіндік беретін геномдық деректерді талдаудың жоғары тиімділігін көрсетеді. Бұл олардың адам эволюциясындағы рөлін, генетикалық әртүрлілікті және олардың денсаулыққа және тұқым қуалайтын ауруларға әсерін терең түсінуге ықпал етеді. Құбырға біріктірілген машиналық оқыту әдістері талдаудың дәлдігін автоматтандырып, жақсарта алады, сондай-ақ оны әртүрлі популяциялар мен деректер түрлеріне бейімдеп, зерттеулер мен практикалық қолдану үшін кең мүмкіндіктер береді. Бағдарлама GitHub репозиторийінде орналастырылған: https://github.com/rkalendar/Repeater https://github.com/rkalendar/TotalRepeats молекулярная биология, биоинформатика, фундаментальные и прикладные задачи биологии, физиологии, биомедицины и биотехнология молекулалық биология, биоинформатика, биологияның, физиологияның, биомедицинаның және биотехнологияның іргелі және қолданбалы мәселелері |
||
UDC indices | ||
575.113.1; 575.822; 577.2.04; 57.011 | ||
International classifier codes | ||
34.15.00; 34.03.23; 34.57.01; 34.23.00; | ||
Readiness of the development for implementation | ||
Key words in Russian | ||
эндогенные ретровирусы; эволюция генома; мобильные элементы; нанопоровое секвенирование; человек; | ||
Key words in Kazakh | ||
эндогенді ретровирустар; геном эволюциясы; ауыстырылатын элементтер; нанокерек секвенирлеу; адам; | ||
Head of the organization | Сарбасов Дос Джурмаханбет | Ph.D. / Профессор |
Head of work | Календарь Руслан Николаевич | Кандидат биологических наук / Профессор |
Native executive in charge |