Inventory number IRN Number of state registration
0323РК00554 AP19677632-KC-23 0123РК00820
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 27616039 AP19677632
Name of work
Метагеномика микробиома иксодовых клещей Казахстана
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Султанкулова Куляйсан Турлыбаевна
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МЗ РК
Full name of the service recipient
"Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности"
Abbreviated name of the service recipient "НИИПББ"
Abstract

Объект исследования - микробиом иксодовых клещей.

Зерттеу объектісі – иксодты кенелердің микробиомасы

Цель проекта - изучение микробиологического разнообразия патогенов иксодовых клещей Казахстана методом секвенирования нового поколения (NGS) при идентификации возбудителей клещевых инфекции и анализ метагеномных данных

Жобаның мақсаты – Қазақстандағы иксод кенелердің патогенді қоздырғыштарының микробиологиялық әртүрлілігін зерттеуді жаңа буынды секвенирлеу (NGS) әдісімен жүргізу және метагеномикалық мәліметтерге талдау жасау

- Анализ микробиома клещей и оценка современного состояния природных очагов клещевых патогенов в РК. Будет проведена оценка современного состояния природных очагов клещевых патогенов в РК с использованием литературных данных: PubMed, Казахстанской базы данных цитирования) и eLibrary (Российский индекс научного цитирования) и др. - Организация и проведение экспедиции для сбора биологического материала клещей из различных регионов РК. Будут организованы и проведены экспедиции для сбора биологического материала клещей из различных регионов РК. Биоматериалы будут доставлены в НИИПББ согласно рекомендациям ВОЗ. - Молекулярно-генетическая идентификация иксодовых клещей. Видовая принадлежность клещей будет определена проведением молекулярно-генетического анализа. - Пробоподготовка и экстракция ДНК клещей. Будет проведена пробоподготовка клещей и экстракция ДНК из исследуемых проб. - Постановка ПЦР для идентификации видов иксодовых клещей, доставленных из различных регионов Казахстана. - Секвенирование фрагментов ДНК клещей. Проведение филогенетического анализа для идентификации видов клещей. Секвенирование фрагментов ДНК клещей будет проведено методом Сэнгера. Будет проведен филогенетический анализ фрагментов ДНК клещей для идентификации видов клещей

- Кенелердің микробиомасын талдау және Қазақстан Республикасындағы кене қоздырғыштарының табиғи ошақтарының қазіргі жағдайын бағалау. Қазақстан Республикасындағы кене қоздырғыштарының табиғи ошақтарының ағымдағы жай-күйіне әдеби деректер: PubMed, Kazakhstan Citation Database және eLibrary (Russian Science Citation Index) және т.б. пайдалана отырып бағалау жүргізілетін болады. - Қазақстан Республикасының әртүрлі аймақтарынан кенелердің биологиялық материалын жинау бойынша экспедиция ұйымдастыру және өткізу. Қазақстан Республикасының әртүрлі аймақтарынан кенелердің биологиялық материалын жинау бойынша экспедициялар ұйымдастырылып, өткізілетін болады. Биоматериалдар ДДҰ ұсынымдарына сәйкес биогеоплазмалық биохимия ғылыми-зерттеу институтына жеткізіледі. - Иксодид кенелерінің молекулалық-генетикалық идентификациясы. Кенелердің түрі молекулалық-генетикалық талдау арқылы анықталады. - Кене ДНҚ үлгісін дайындау және экстракциялау. Кене үлгісін дайындау және сынақ үлгілерінен ДНҚ экстракциясы жүргізіледі. - Қазақстанның әртүрлі аймақтарынан әкелінген иксодид кенелерінің түрлерін анықтау үшін ПТР сынағы. - Кене ДНҚ фрагменттерінің секвенирленуі. Кене түрлерін анықтау үшін филогенетикалық талдау жүргізу. Кененің ДНҚ фрагменттерін секвенирлеу Сэнгер әдісі арқылы жүзеге асырылады. Кене түрлерін анықтау үшін кене ДНҚ фрагменттеріне филогенетикалық талдау жүргізіледі

Проведен анализ микробиома клещей и оценены современные состояния природных очагов клещевых патогенов в РК. В оcений период 2023 г. организованы и проведены экспедиции для сбора и транспортировки биологических образцов кровососущих клещей. 2183 образцов разных видов клещей доставлены из различных областей Казахстана. С использованием молекулярно-генетических методов определена видовая принадлежность иксодовых клещей, доставленных из различных регионов Казахстана. Наработаны ПЦР продукты ДНК-маркеров клещей COI, 16S рДНК, ITS2 и 12S рДНК классическим методом ПЦР. Определена нуклеотидная последовательность фрагментов ДНК клещей, которая относится к иксодовым и аргасовым клещам. На сегодняшний день выявлены 5 видов клещей семейства Ixodidae: Hyalomma scupense, Hyalomma anatolicum, Hyalomma detritum, Rhipicephalus turanicus, Hyalomma excavatum и 1 вид семейства Argasidae: Argas persicus

Кенелердің микробиомасына талдау жүргізілді және ҚР-дағы кене патогендерінің табиғи ошақтарының қазіргі жай-күйі бағаланды. 2023 ж. күзінде қан соратын кенелердің биологиялық үлгілерін жинау және тасымалдау үшін экспедициялар ұйымдастырылып, өткізілді. Қазақстанның өңірлерінен кенелердің әртүрлі түрлерінің 2183 үлгісі жеткізілді. Молекулярлық-генетикалық әдістерді пайдалана отырып, Қазақстанның әртүрлі өңірлерінен жеткізілген иксод кенелерінің қандай түрге жататындығы анықталды. Кенелердің COI, 16S рДНҚ, ITS2 және 12S рДНҚ ДНҚ маркерлерінің ПТР өнімдерін әзірлеу классикалық ПТР әдісімен жүзеге асырылды. Кене ДНҚ фрагменттерінің нуклеотидтік тізбегі анықталды, ол иксод және аргас кенелеріне жатады. Бүгінгі таңда Ixodidae тұқымдасына жататын кенелердің 5 түрі анықталды: Hyalomma scupense, Hyalomma anatolicum, Hyalomma detritum, Rhipicephalus turanicus, Hyalomma excavatum және Argasidae тұқымдасының 1 түрі: Argas persicus

2183 образцов разных видов клещей из различных областей Казахстана пулированы и исследованы в ПЦР. Определены ДНК-маркеры клещей: COI, 16S рДНК, ITS2 и 12S рДНК. Выявлены 5 видов клещей семейства Ixodidae: Hyalomma scupense, Hyalomma anatolicum, Hyalomma detritum, Rhipicephalus turanicus, Hyalomma excavatum и 1 вид семейства Argasidae: Argas persicus

Қазақстанның әртүрлі аймақтарынан алынған кенелердің 2183 үлгілері біріктіріліп, ПТР әдісімен тексерілді. Кене ДНҚ маркерлері анықталды: COI, 16S rDNA, ITS2 және 12S rDNA. Ixodidae тұқымдасына жататын кенелердің 5 түрі анықталды: Hyalomma scupense, Hyalomma anatolicum, Hyalomma detritum, Rhipicephalus turanicus, Hyalomma excavatum және Argasidae тұқымдасының 1 түрі: Argas persicus

Полученные результаты будут применяться в МЗ РК и МСХ РК по предупреждению и недопущению особо опасных клещевых инфекций в Республике Казахстан

Алынған нәтижелер Қазақстан Республикасының Денсаулық сақтау министрлігінде және Ауыл шаруашылығы министрлігінде кене арқылы таралатын аса қауіпті инфекциялардың алдын алу және алдын алу үшін пайдаланылуда қолданылады

UDC indices
579.62:578.5
International classifier codes
34.15.23;
Key words in Russian
иксодовый клещ; микробиом; метагеном; секвенирование; генетический анализ;
Key words in Kazakh
иксодты кене; микробиом; метагеном; секвенирлеу; генетикалық талдау;
Head of the organization Керимбаев Аслан Амангельдиевич / нет
Head of work Султанкулова Куляйсан Турлыбаевна Кандидат биологических наук / Профессор