The object of research, development or design (in Russian) : ДНК Francisella tularensis subsp holarctica и F. tularensis subsp mediasiatica

The object of research, development or design (in Kazakh) : Francisella tularensis subsp holarctica және F. tularensis subsp mediasiatica ДНҚ

Aim of work (in Russian) : Полногеномное секвенирование коллекционных штаммов F. tularensis subsp mediasiatica и выделение бактериальных изолятов F. tularensis subsp mediasiatica.

Aim of work (in Kazakh) : F. tularensis subsp mediasiatica-ның бактериалды изоляттарын бөліп алу және F. tularensis subsp mediasiatica-ның жинақ штаммдарын толықгеномды секвенерлеу.

Методы исследования (на русском) : Использованы молекулярно-генетические и микробиологические методы

Методы исследования (на казахском) : Молекулалық-генетикалық және микробиологиялық әдістер қолданылды

Obtained results and novelty (in Russian) : Была выделена ДНК из 28 коллекционных штаммов F. tularensis subsp mediasiatica. Было проведено полногеномное секвенирование 28 коллекционных штаммов F. tularensis subsp mediasiatica. Количество полученных прочтений на одни образец варьирует от 400 тыс. до 1400 тыс. Средняя длина прочтений составила 267 пар нуклеотидов, метрика GC% составляет 32%, что характерно для F. tularensis subsp mediasiatica. Был проведен сбор 699 проб биологического материала от естественно восприимчивых животных и кровососущих переносчиков из очагов туляремии Алматинской, Жамбылской и Восточно-Казахстанской областей. Было проведено выявление Francisella tularensis и подвидовая дифференциация F. tularensis subsp mediasiatica в биологическом материале методом ПЦР в режиме реального времени. Методом ПЦР в 34 пробах был выявлен генетический материал F. Tularensis. Было проведено выделение 4 бактериальных изолятов F. tularensis subsp mediasiatica из биологического материала от естественно восприимчивых животных (грызуны, зайцеобразные) а также от кровососущих переносчиков.

Obtained results and novelty (in Kazakh) : F. tularensis subsp mediasiatica-ның 28 жинақты штаммынан ДНҚ бөліп алынды. F. tularensis subsp mediasiatica-ның 28 жинақты штаммына толықгеномды секвенерлеу жүргізілді. Бір үлгіге шаққандағы оқылым нәтижесі 400-ден 1400 мыңға дейін ауытқиды. Оқылымның орташа ұзындығы 267 жұп нуклеотиді құрайды, оның 32 пайызы GC% метрикасын құрайды. Бұл F. tularensis subsp mediasiatica-ға тән қасиет болып табылады. Туляремия ошағы болып табылатын Алматы, Жамбыл және Батыс Қазақстан өңірлердің табиғи сезімтал жануарлары мен қан соратын тасымалдаушыларынан 699 биологиялық үлгі жиналды. Нақты уақыт режиміндегі ПТР әдісімен биологиялық үлгілерден Francisella tularens анықталып, олардың F. tularensis subsp mediasiatica кіші түрлеріне саралау жүргізілді. ПТР әдісі бойынша 34 үлгіден F. Tularensis-тің генетикалық материалы анықталды. Табиғи сезімтал жануарлар (кеміргіштер, қоянтәрізділер), сонымен қатар қан соратын тасымалдаушылардың биологиялық үлгілерінен F. tularensis subsp mediasiatic-ның 4 изоляты бөліп алынды.

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Проведено полногеномное секвенирование 28 коллекционных штаммов F. tularensis subsp mediasiatica проведен сбор 699 проб биологического материала от естественно восприимчивых животных и выделены бактериальных изолятов F. tularensis subsp mediasiatica.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : F. tularensis subsp mediasiatica-ның 28 жинақты штаммына толықгеномды секвенерлеу жүргізілді. Табиғи сезімтал жануарлар 699 биологиялық үлгі жиналды және F. tularensis subsp mediasiatica-ның бактериалды изоляттары бөліп алынды.

Level of implementation (in Russian) : Не внедрено

Level of implementation (in Kazakh) : Енгізілген жоқ

Efficiency (in Russian) : В результате секвенирования получено от 400 тыс. до 1400 тысяч. прочтений на один штамм, что достаточно для проведения биоинформатического анализа. Собрано 699 проб биологического материала и проведено его тестирование на наличие генетического материала F. tularensis, выделены бактериальные изоляты

Efficiency (in Kazakh) : Секвенерлеу нәтижесінде бір штаммға шаққанда 400-ден 1400 мыңға дейін оқылым алынды. Бұл биоинформатикалық талдауға жарамды болып табылады. 699 биологиялық үлгі жиналды және ол үлгілердін F. tularensis материалын анықтауға арналған тестілеу жүргізілді, бактериалды изоляттар бөліп алынды.

Field of application (in Russian) : Диагностика, эпидемиологический мониторинг за особо опасными инфекциями

Field of application (in Kazakh) : Аса қауіпті инфекциялардың диагностикасы, эпидемиологиялық мониторингі