Inventory number IRN Number of state registration
0223РК00335 AP09058270-OT-23 0121РК00039
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 3 66
Total number of pages Patents Illustrations
62 0 23
Amount of funding Code of the program Table
17760307 AP09058270 0
Name of work
Оценка биохимической активности ферментов репарации ДНК клинически важных бактерий
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Другая (укажите)
Report authors
Абельденов Сайлау Касенович , Жумакаев Ануар Рысбекович , Тургимбаева Айгерим Макашкызы , Зейн Ұлан Өтеғалиұлы , Аманжолова Меруерт ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Объектами исследования являются ферменты репарации ДНК TagA M. tuberculosis и Ung H. pylori

Зерттеу объектілері - M. tuberculosis-тің TagA және H. pylori-дің Ung ДНҚ жөндеу ферменттері.

Цель проекта - структурно-функциональное исследование активности ранее не изученных ферментов репарации ДНК человеческих патогенов M. tuberculosis и H. pylori

Жобаның мақсаты – адам туберкулезі M.tuberculosis және H.pylori қоздырғыштарының бұрын зерттелмеген ДНҚ жөндеу ферменттерінің белсенділігін құрылымдық-функционалдық зерттеу.

Методы проведения работы - методы молекулярной биологии и биохимии

Жұмыс әдістері – молекулалық биология және биохимия әдістері

Получены генетические конструкции pGEM-T/MtbTagA, pGEM-T/HpUNG, pET28c/MtbTagA, pET28c/HpUNG. Оптимизированы условия экспрессии генов рекомбинантными штаммами Arctic Express (DE3)/pET28c(+)/MtbTagA и Arctic Express (DE3)/pET28c(+)/HpUNG. С помощью двуступенчатой аффинной хроматографии получены рекомбинантные белки с 95% электрофоретической чистотой. MtbTagA образует никированную плазмиду после метилирования ДНК. Оптимальные условия для HpUNG: 20 мМ Трис-HCl pH 8,0, 1 мМ ЭДТА, 0,1 мг/мл БСА, 1 мМ ДТТ, +37°C. HpUNG эффективно устраняет урацил: Vmax 0,6178 нМ×мин-1, KM 12,15 нМ. После гомологичного моделирования были получены мутанты HpUNG N136D и HpUNG H200Q. Показано, что замены N136D и H200Q приводят к снижению и полной потере активности, что подтверждает консервативность и важную роль данных аминокислот в гомологичных урацил-ДНК-гликозилазах. Экспрессия генов ферментов MtbTagA и HpUNG в мутантных клетках E. coli обеспечивает устойчивость при генотоксичных условиях.

pGEM-T/MtbTagA, pGEM-T/HpUNG, pET28c/MtbTagA, pET28c/HpUNG генетикалық құрылымдары алынды. Ген экспрессиясының шарттары Arctic Express (DE3)/pET28c(+)/MtbTagA және Arctic Express (DE3)/pET28c(+)/HpUNG рекомбинантты штаммдары үшін оңтайландырылған. Екі сатылы аффинді хроматография көмегімен 95% электрофоретикалық тазалығы бар рекомбинантты ақуыздар алынды. MtbTagA ДНҚ метилденуінен кейін никтелген плазмида түзеді. HpUNG үшін оңтайлы шарттар: 20 мМ Tris-HCl pH 8,0, 1 мМ EDTA, 0,1 мг/мл BSA, 1 мМ DTT, +37°C. HpUNG урацилді тиімді жояды: Vmax 0,6178 nM×min-1, KM 12,15 nM. Гомологиялық модельдеуден кейін HpUNG N136D және HpUNG H200Q мутанттары алынды. N136D және H200Q алмастырулары белсенділіктің төмендеуіне және толық жоғалуына әкелетіні көрсетілді, бұл осы аминқышқылдарының гомологты урацил-ДНҚ гликозилазаларында сақталуы мен маңызды рөлін растайды. Мутантты E. coli жасушаларында MtbTagA және HpUNG фермент гендерінің экспрессиясы генотоксикалық жағдайларда төзімділікті қамтамасыз етеді.

-

-

-

-

-

-

Фундаментальные знания

Негізгі білім

UDC indices
34.15.27; 31.27.17; 76.29.34
International classifier codes
34.15.27; 31.27.17; 76.29.34;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
ПАТОГЕН; РЕПАРАЦИЯ ДНК; РЕКОМБИНАНТНЫЙ БЕЛОК; ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИНЖЕНЕРИЯ; ТУБЕРКУЛЕЗ;
Key words in Kazakh
ПАТОГЕН; ДНҚ РЕПАРАЦИЯ; РЕКОМБИНАНТТЫ АҚУЫЗ; ГЕНЕТИКАЛЫҚ ИНЖЕНЕРИЯ; ТУБЕРКУЛЕЗ;
Head of the organization Искакова Айша Нурбековна Ph.D /
Head of work Абельденов Сайлау Касенович Phd / нет
Native executive in charge