The object of research, development or design (in Russian) : Клинические изоляты микобактерий туберкулеза, ДНК клинических изолятов M. tuberculosis, ДНК референсного штамма M. tuberculosis H37Rv.

The object of research, development or design (in Kazakh) : микобактерияларының клиникалық изоляттары, M. tuberculosis клиникалық изоляттарының ДНҚ-ы, референсті M. tuberculosis H37Rv штаммының ДНҚ-ы.

Aim of work (in Russian) : Целью исследования является проведение комплексной молекулярно-генетической характеристики генотипа Beijing M. tuberculosis в Казахстане.

Aim of work (in Kazakh) : Зерттеу жұмысының мақсаты Қазақстандағы Beijing M. tuberculosis генотипіне кешенді молекулалық-генетикалық сипаттама жүргізу болып табылады.

Методы исследования (на русском) : Сбор 759 клинических изолятов M.tuberculosis от впервые выявленных и повторных случаев туберкулеза, проведена молекулярно-генетическая характеристика и оценка генотипа Beijing M.tuberculosis, полногеномное секвенирование клинических изолятов генотипа Beijing M.tuberculosis.

Методы исследования (на казахском) : Осы жобаның міндеттерін орындау үшін есеп беру кезеңіңде 759 клиникалық изолят жиналды, оның ішінде туберкулездің жаңа және қайталанған жағдайлары арасынан жиналды, Beijing M. tuberculosis генотипі бағалаланды және оның молекулалық-генетикалық сипаттамасы берілді, Beijing M. tuberculosis генотипі клиникалық изоляттарының толық геномды секвенирлеуі өткізілді.

Obtained results and novelty (in Russian) : Проведено MIRU-VNTR генотипирование M.tuberculosis и идентифицировано 10 генетических семейств. Результаты генотипирования показал, что самым доминирующим семейством, циркулирующим в Казахстане, остается китайский генотип Beijing, который встречался в общей выборке 65,2% (n=495) случаях. По классификации MLVA MtbC 15-9 и выявлено 119 вариантов цифровых профилей. Большая часть кластеризованных изолятов генотипа Beijing 79,85% (325/407) были лекарственно-устойчивыми. Из всех кластеров Beijing особо выделяется кластер 94-32 (63,9%; 260/407), самый многочисленный, относящийся к центрально-азиатскому кластеру, и в большинстве был представлен лекарственно-устойчивыми образцами (81,9%; 213/260) (p=0,010), при этом среди устойчивых изолятов кластер 94-32 преобладали образцы с МЛУ (61,1%; 159/213) (p=0,070), что подчеркивает его важную роль в распространении лекарственно-устойчивых и особенно мультирезистентных форм M. tuberculosis в Казахстане Генотип Beijing был взаимосвязан с мультирезистентным туберкулезом (p

Obtained results and novelty (in Kazakh) : M.tuberculosis изоляттары MIRU-VNTR әдісімен генотиптелді және 10 генетикалық тұқымдас анықталды. Генотиптеу нəтижелері Қазақстанда таралған ең басым тұқымдас Beijing генотипі болып қала беретінін көрсетті, ол жалпы үлгі топтамасында 65,2% (n=495) жағдайда табылды. MtbC 15-9 MLVA классификациясына сәйкес сандық профильдердің 119 нұсқасы анықталды. Кластерленген Beijing генотипі изоляттарының көпшілігі 79,85% (325/407) дәріге төзімді болды. Beijing генотипінің барлық кластерлерінің ішінде 94-32 кластері (63,9%; 260/407) ерекшеленеді, Орталық Азия кластеріне жататын изоляттар ең көп мөлшерде кездеседі және көбісі дәріге төзімді (81,9%; 213/260) ( p=0,010), ал төзімді изоляттардың арасында 94-32 кластерінде мультирезистентті (61,1%; 159/213) (p=0,070) үлгілері басым болды, бұл оның Қазақстанда дәріге төзімді және әсіресе көптік дәріге төзімді M. tuberculosis изоляттардың таралуындағы маңызды рөлін атап көрсетеді. Beijing генотипі мультирезистентті туберкулезбен ассоциациясын (p

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Проведен анализ разных схем генотипирования, состоящих из стандартных 24, 15 и 12 MIRU-VNTR локусов, а также 7 MIRU-VNTR локусов с высокими показателями аллельного полиморфизма казахстанских изолятов M. tuberculosis. Предложена оптимизированная схема, состоящая из 7 локусов показала дискриминирующую способность (HGDI=0,94, CR=0,45). По результатам исследований были подготовлены и опубликованы методические рекомендации на казахском и русском языках. В рамках проекта проведено полногеномное секвенирование 22 клинических изолятов M.tuberculosis. Нами проведено определение лекарственной устойчивости для 10 pre-XDR клинических изолятов M.tuberculosis и рекомендовано к использованию четыре программы баз геномных данных (TB-Profiler, CASTB, Mykrobe и ResFinder). Для определения происхождения и филогенетической ветви (outbreak clade) рекомендован инструмент MTBseq для анализа полногеномных данных.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Стандартты 24, 15 және 12 MIRU-VNTR локустарынан, сондай-ақ қазақстандық M. tuberculosis изоляттарының аллельді полиморфизмінің жоғары көрсеткіштерін көрсеткен 7 MIRU-VNTR локустарынан тұратын әртүрлі генотиптеу ссызбанұсқалары анализденді. 7 локустан тұратын оңтайландырылған сызбанұсқа ұсынылды, сызбанұсқанын дискриминациялық қабілетті HGDI=0,94 (CR=0,45). Зерттеу нәтижелері бойынша қазақ және орыс тілдерінде әдістемелік нұсқаулар дайындалды және жарияланды. Жоба аясында 22 M. tuberculosis клиникалық изоляттарының толық геномды секвенирлеуі өткізілді. Біз 10 пре-XDR M. tuberculosis клиникалық изоляттарының дәріге төзімділігін анықтадық және пайдалануға төрт геномдық мәліметтер базасының бағдарламасын (TB-Profiler, CASTB, Mykrobe және ResFinder) ұсындық. Толық геномды мәліметтердің анализінде шығу тегі мен филогенетикалық тармағын (outbreak clade) анықтау үшін MTBseq құралын ұсындық.

Level of implementation (in Russian) : Предложена оптимизированная схема, состоящая из 7 локусов показала дискриминирующую способность (HGDI=0,94, CR=0,45). По результатам исследований были подготовлены и опубликованы методические рекомендации на казахском и русском языках

Level of implementation (in Kazakh) : 7 локустан тұратын оңтайландырылған сызбанұсқа ұсынылды, сызбанұсқанын дискриминациялық қабілетті HGDI=0,94 (CR=0,45). Зерттеу нәтижелері бойынша қазақ және орыс тілдерінде әдістемелік нұсқаулар дайындалды және жарияланды

Efficiency (in Russian) : нет

Efficiency (in Kazakh) : жоқ

Field of application (in Russian) : медицина, в частности во фтизиатрии

Field of application (in Kazakh) : медицина, атап айтқанда фтизиатрия