Inventory number IRN Number of state registration
0223РК00602 AP09259034-OT-23 0121РК00402
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 3
International publications: 2 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 10 109
Total number of pages Patents Illustrations
101 0 6
Amount of funding Code of the program Table
22999642 AP09259034 10
Name of work
Изучение клинико-генетических аспектов раннего развития рака молочной железы на основе секвенирования нового поколения
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Методическая документация
Report authors
Жунусова Гульнур Сагиндыковна , Мить Наталья Викторовна , Скворцова Лилия Александровна , Әбдікерім Салтанат Ержанқызы , Омарбаева Назгуль Айдарбековна , Ерғали Қанағат ,
0
0
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское государственное предприятия на праве хозяйственного ведения «Институт генетики и физиологии» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ ИГИФ КН МОН РК
Abstract

Объектом исследования являлись образцы крови пациенток с ранним развитием рака молочной железы (до 40 лет) и контрольной группы.

Зерттеу нысандары: сүт безі қатерлі ісігінің ерте дамуы (40 жасқа дейін) бар науқастар мен бақылау тобының қан үлгілері.

Комплексный анализ вклада генетических вариантов в патогенез и клиническую гетерогенность рака молочной железы в молодой казахской популяции и разработка рекомендаций по внедрению методов ранней молекулярно-генетической диагностики и скрининговых программ в Казахстане.

Жобаның мақсаты: жас қазақ популяциясындағы сүт безі қатерлі ісігі патогенезі мен клиникалық гетерогенділігіне генетикалық нұсқалардың үлесін кешенді талдау және Қазақстанда ерте молекулярлы-генетикалық диагностика мен скринингтік бағдарламалар әдістерін енгізу бойынша ұсынымдар әзірлеу.

В работе применялись cоциологические, клинические, молекулярно-генетические, биоинформатические и статистические методы анализа.

Жұмыста социологиялық, клиникалық, молекулалық-генетикалық, биоинформатикалық және статистикалық талдау әдістері қолданылды.

Проведено таргетное секвенирование образцов ДНК 224 пациенток с РМЖ и 163 условно здоровые лица на платформе Miseq Illumina. Впервые в популяции молодых женщин-казашек охарактеризован спектр и частота популяционно-специфических генетических вариантов, ассоциированных с ранним развитием РМЖ. Обнаружено 38 патогенных мутаций у 25,4% пациенток, большинство из них в генах BRCA1/2 (17,0%). В не-BRCA генах частота мутаций была почти в 2 раза меньше (8,5%). Впервые в популяции этнических казашек выявлены 6 новых вариантов. Мутации c.5266dupC, c.5278-2del, c.2T>C в гене BRCA1 и c.9409dupA, c.9253delA в гене BRCA2 могут быть фаундерными для казахской популяции. Установлена ассоциация между носительством патогенных вариантов в гене BRCA1 и развитием трижды негативного РМЖ, а также наличием отягощенного семейного анамнеза. Выделены группы риска раннего развития РМЖ. Разработаны панели генетических маркеров для определения предрасположенности к развитию РМЖ у этнических казашек.

MiSeq Illumina платформасында 224 СБҚІ науқастарының және 163 шартты сау топтың ДНҚ үлгілеріне таргетті секвенирлеу жүргізілді. Жас қазақ әйелдерінің популяциясында алғаш рет СБҚІ ерте дамуымен байланысты популяцияға тән генетикалық варианттардың спектрі мен жиілігі сипатталды. 57 пациентте 38 патогендік мутация анықталды (25,4%), олардың көпшілігі BRCA1/2 гендерінде (17,0%). BRCA емес гендерде мутация жиілігі шамамен 2 есе аз болды (8,5%). Этникалық қазақтар популяциясында алғаш рет 6 жаңа нұсқа анықталды. BRCA1 геніндегі c.5266dupc, c.5278-2 del, c.2 T>C және BRCA2 геніндегі c.9409dupA, c.9253delA мутациялары қазақ популяциясы үшін фаундерлі болуы мүмкін. BRCA1 геніндегі патогендік варианттардытасымалдау мен үш есе теріс СБҚІ дамуы, сондай-ақ отбасында қатерлі ісіктің болуы арасында ассоциация құрылды.

Проведено анализ >1700 экзонов 94 таргетных онкогенов; опубликовано 5 работ, из них 1 статья в рецензируемом научном издании, входящем в 1 квартиль в базе Web of Science.

> 1700 экзон 94 таргетті онкогенге талдау; 5 жұмыс, оның ішінде WEB of Science базасында 1-ші квартильге кіретін рецензияланатын ғылыми басылымда  1 мақала жарияланды.

Разработаны методические рекомендации по ранней диагностике и внедрению методов генетического анализа в программу скрининга рака молочной железы в Казахстане.

Қазақстанда сүт безі қатерлі ісігі скрининг бағдарламасына генетикалық талдау әдістерін ерте диагностикалау және енгізу бойынша әдістемелік ұсынымдар әзірленді.

Создание панели генетических маркеров и разработка рекомендаций для диагностики РМЖ, которые существенно расширят возможности национальной скрининговой программы по РМЖ и усилит их эффективность.

Генетикалық маркерлер панелін құру және СБҚІ бойынша Ұлттық скринингтік бағдарламаның мүмкіндіктерін едәуір кеңейтетін және олардың тиімділігін арттыратын СБҚІ диагностикасы үшін ұсыныстар әзірлеу.

Онкология, маммология, генетика, общественное здравоохранение.

Онкология, маммология, генетика, қоғамдық денсаулық сақтау.

UDC indices
577.2, 577.218, 575.224.22, 575.224.29
International classifier codes
34.15.23; 34.15.51;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Рак молочной железы; генетическая предрасположенность; патогенная мутация; однонуклеотидный полиморфизм; NGS-секвенирование;
Key words in Kazakh
Сүт безінің қатерлі ісігі; генетикалық бейімділік; патогендік мутация; бір нуклеотидті полиморфизм; NGS-секвенирлеу;
Head of the organization Жунусова Гульнур Сагиндыковна PhD /
Head of work Жунусова Гульнур Сагиндыковна PhD в области биологических наук / Ассоциированный профессор
Native executive in charge