Inventory number IRN Number of state registration
0323РК00579 AP19680500-KC-23 0123РК00725
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Краткие сведения Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 0 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Patents Amount of funding Code of the program
0 27345811.5 AP19680500
Name of work
Изучение молекулярных механизмов репарации ошибочно спаренных нуклеотидов у возбудителя туберкулеза Mycobacterium tuberculosis
Type of work Source of funding Report authors
Fundamental Абельденов Сайлау Касенович
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Товарищество с ограниченной ответственностью "Национальный центр биотехнологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Национальный центр биотехнологии"
Abstract

Фермент системы репарации ДНК

ДНҚ жөндеу фермент

Целью Проекта является биохимическая характеристика ранее неизученного фермента репарации ДНК – NucS Mycobacterium tuberculosis

Жобаның мақсаты бұрын зерттелмеген Mycobacterium tuberculosis NucS ДНҚ қалпына келтіру ферментінің биохимиялық сипаттамасы болып табылады

Методы молекулярной биологии и биохимии

Молекулярлық биология және биохимия әдістері

Проведено клонирование гена эндонуклеазы NucS (MtbNucS) в экспрессирующие вектора pET-28c(+) и pMBP-parallel 2. Проведено клонирование гена эндонуклеазы NucS в экспрессирующий вектор pMBP-parallel 2. Проведено клонирование гена бета-субъединицы ДНК полимеразы III (бета-клампа) в вектор pET-28c(+). Полученная генетическая конструкция позволяет получить рекомбинантный белок с дополнительной гексагистидиновой меткой. Полученные рекомбинантные вектора были просеквенированы с помощью метода Сэнгера. Все генетические конструкции были проверены на предмет содержания мутаций, последовательности открытых рамок считывания. Проведена оптимизация экспрессии рекомбинантных белков MtbNucS и MtbDnaN. Были использованы следующие штаммы Eschericha coli - ArcticExpress (DE3), BL21 (DE3) и Rosetta(DE3). Наибольшей экспрессией обладали штаммы ArcticExpress (DE3) и BL21 (DE3). Оптимальными условиями индукции рекомбинантных белков были следующими – температура 22°С, время культивирования 16 ч., концентрация изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозида 0,2 мМ. Проведена наработка клеточной биомассы, лизис и хроматографическая очистка рекомбинантных белков MtbNucS и MtbDnaN. Клеточную биомассу нарабатывали в объеме 1-2 л среды LB с соответствующим антибиотиком. Проведена очистка рекомбинантных белков MtbNucS и MtbDnaN с использованием хроматографических колонок HisTrap HP и MBPTrap HP. Высокую степень очистки подтверждали электрофорезом белков в полиакриламидном геле, чистота составила >90%.

NucS эндонуклеаза гені (MtbNucS) pET-28c(+) және pMBP-параллель 2 экспрессия векторларына клондалған NucS эндонуклеаза гені pMBP-параллель 2 экспрессия векторына клондалған. ДНҚ-полимераза III (бета қысқыш) бета суббірлігіне арналған ген pET-28c(+) векторына клондалған. Алынған генетикалық құрылым қосымша гексахистидин тегі бар рекомбинантты ақуызды алуға мүмкіндік береді. Алынған рекомбинантты векторлар Сэнгер әдісі арқылы реттелген. Барлық генетикалық құрылымдар мутация мазмұны мен ашық оқу кадр тізбегі үшін тексерілді. MtbNucS және MtbDnaN рекомбинантты ақуыздарының экспрессиясы оңтайландырылды. Келесі Eschericha coli штамдары қолданылды - ArcticExpress (DE3), BL21 (DE3) және Rosetta (DE3). ArcticExpress (DE3) және BL21 (DE3) штаммдары ең жоғары өрнекке ие болды. Рекомбинантты ақуыздарды индукциялау үшін оңтайлы жағдайлар келесідей болды: температура 22°С, өсіру уақыты 16 сағат, изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозид концентрациясы 0,2 мМ. Жасуша биомассасын алу, лизис және MtbNucS және MtbDnaN рекомбинантты ақуыздарды хроматографиялық тазарту жүргізілді. Жасушалық биомасса тиісті антибиотикпен LB ортасының 1-2 л көлемінде өндірілді. MtbNucS және MtbDnaN рекомбинантты ақуыздары HisTrap HP және MBPTrap HP хроматографиялық бағандары арқылы тазартылды. Тазартудың жоғары дәрежесі полиакриламидті гельдегі ақуыз электрофорезі арқылы расталды, тазалығы >90% құрады.

-

-

-

-

-

-

Фундаментальные знания

Негізгі білім

UDC indices
577.212.3
International classifier codes
34.15.27; 31.27.17; 76.29.53; 31.27.19;
Key words in Russian
ПАТОГЕН; РЕПАРАЦИЯ ДНК; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; БАКТЕРИЯ; ТУБЕРКУЛЕЗ;
Key words in Kazakh
ПАТОГЕН; ДНҚ РЕПАРАЦИЯ; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; БАКТЕРИЯ; ТУБЕРКУЛЕЗ;
Head of the organization Искакова Айша Нурбековна Phd / нет
Head of work Абельденов Сайлау Касенович Phd / нет