Inventory number IRN Number of state registration
0223РК00072 BR18574099-OT-23 0123РК00027
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Промежуточный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 0
International publications: 1 Publications Web of science: 0 Publications Scopus: 0
Number of books Appendicies Sources
1 5 41
Total number of pages Patents Illustrations
47 0 4
Amount of funding Code of the program Table
40040000 Ф.1063 6
Code of the program's task under which the job is done
05
Name of work
Разработка и внедрение молекулярно-генетических систем ускоренной идентификации карантинных патогенов и вредителей растений
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Метод, способ
Report authors
Гриценко Диляра Александровна , Низамдинова Гульназ Камирдиновна , Таскужина Айша Кайратовна , Керімбек Назым Мұратбекқызы , Абдрахманова Айша Бауыржановна , Моисеев Руслан Махмудович , Колченко Мария ,
0
1
2
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

Candidatus Liberibacter solanacearum, непарный шелкопряд.

Candidatus Liberibacter solanacearum, сарықанат жібек көбелегі

Молекулярно-генетическое изучение и разработка систем ускоренной идентификации карантинных патогенов и вредителей растений для контроля над их распространением в стране.

Карантиндік қоздырғыштар мен өсімдік зиянкестерінің елде таралуын бақылау үшін оларды молекулалық-генетикалық зерттеу және жедел анықтау жүйелерін әзірлеу.

В работе использовались методы биоинформатического анализа, методы генетической инженерии и молекулярной биологии.

Жұмыста биоинформатикалық талдау әдістері, гендік инженерия және молекулалық биология әдістері қолданылды.

Был проведен биоинформатический анализ геномных регионов разных штаммов Ca. Liberibacter solanacearum, а также разных регионов митохондриона Lymantria dispar. Были выявлены перспективные регионы геномов для каждого объекта, которые преимущественно располагались в генах, кодирующих 16S рРНК у бактерии и цитохром оксидазы у шелкопряда. В проекте были разработаны праймеры для обнаружения Ca. Liberibacter solanacearum методом петлевой изотермической амплификации, а также модуль для аннотации результатов диагностики, который может быть использован в поле. Модуль включает элемент Пельтье, что позволяет быстрому нагреву/охлаждению и быстрой амплификации в течение 15-30 минут. Поскольку Ca. Liberibacter solanacearum не была обнаружена в отобранных 270 образцах растительного материала, при разработке праймеров особое внимание было уделено тестированию на положительных 164 -х синтетических контролях. Для обнаружения непарного шелкопряда азиатской линии были разработаны праймеры и проба для детекции методом qPCR. При анализе непарного шелкопряда было выявлено 188 образцов принадлежащих европейской расе с интрогрессией азиатского подвида, 4 образцов настоящего европейского подвида и 2 спорных образцов японской расы.

Ca.Liberibacter solanacearum әртүрлі штаммдарының геномдық аймақтарына, сондай-ақ Lymantria dispar митохондриясының әртүрлі аймақтарына биоинформатикалық талдау жүргізілді. Әрбір объект үшін геномдардың перспективалы аймақтары анықталды, олар негізінен бактериядағы 16s рРнқ және сарықанат жібек көбелегінің цитохром оксидазасын кодтайтын гендерде орналасқан. Жобада Ca.Liberibacter solanacearum бактериясынын циклдік изотермиялық күшейту әдісімен анықтау үшін праймерлер, сондай-ақ егістікте қолдануға болатын диагностикалық нәтижелерге аннотация модулі жасалды Модуль 15-30 минут ішінде жылдам қыздыруға/салқындатуға және жылдам амплификацияға мүмкіндік беретін Пельтье элементін қамтиды. Ca.Liberibacter solanacearum таңдалған 270 өсімдік материалының үлгілерінде табылмағандықтан, праймерлерді әзірлеу кезінде 164 оң синтетикалық бақылауларда сынауға ерекше назар аударылды. Сарықанат жібек көбелегінің азиялық түр тармағын анықтау үшін qPCR әдісімен детекциялау үшін праймерлер мен сынама әзірленді. Сарықанат жібек көбелегін талдау кезінде азиялық түр тармағымен интрогрессиясы бар еуропалық нәсілге жататын 188 үлгі, 4 үлгі нағыз еуропалық және 2 үлгі жапон түр тармағына тиесілі екені анықталды.

Было проведено тестирование разработанных праймеров для детекции Ca. Liberibacter solanacearum на 164 синтетических контролей и 270 образцах растительного материала методом изотермической амплификации. Для обнаружения непарного шелкопряда азиатской линии были разработаны праймеры и проба для детекции методом qPCR. При анализе непарного шелкопряда было выявлено 188 образцов принадлежащих европейской расе с интрогрессией азиатского подвида, 4 образцов настоящего европейского подвида и 2 спорных образцов японской расы.

Ca.Liberibacter solanacearum анықтау үшін әзірленген праймерлер изотермиялық амплификациялау әдісімен 164 синтетикалық бақылауда және өсімдік материалының 270 үлгісінде сыналған. Сарықанат жібек көбелегінің азиялық түр тармағын анықтау үшін qPCR әдісімен детекциялау үшін праймерлер мен сынама әзірленді. Сарықанат жібек көбелегін талдау кезінде азиялық түр тармағымен интрогрессиясы бар еуропалық нәсілге жататын 188 үлгі, 4 үлгі нағыз еуропалық және 2 үлгі жапон түр тармағына тиесілі екені анықталды.

Разработанные тест-системы проходят стадию апробации на опытном материале

Әзірленген тест-жүйелер тәжірибелік материалда апробация сатысынан өтуде

Фитоэкспертиза, молекулярная фитопатология, агропромышленный комплекс, научно-исследовательские лаборатории по диагностике фитопатогенов, КазНИИ аграрного направления, сельскохозяйственные частные организации.

Фитосараптама, молекулалық фитопатология, агроөнеркәсіптік кешен, фитопатогендерді диагностикалау бойынша ғылыми-зерттеу зертханалары, аграрлық бағыттағы ҚазҒЗИ, жеке ауыл шаруашылығы ұйымдары.

UDC indices
632.3.01/.08, 632.7.04/.08, 632.92, 577.2
International classifier codes
68.37.31; 68.37.29; 34.15.29; 34.27.21; 34.23.35;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
карантинный объект; инвазивный вид; урожайность; генетический маркер; системы обнаружения; олигонуклеотиды; амплификация;
Key words in Kazakh
карантиндік объект; инвазивті түрлер; өнімділік; генетикалық маркер; анықтау жүйелері; олигонуклеотидтер; амплификация;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / Академик Национальной Академии Наук Республики Казахстан
Head of work Гриценко Диляра Александровна PhD в области биологических наук / нет
Native executive in charge