The object of research, development or design (in Russian) : Использовались назофаренгальные смывы людей

The object of research, development or design (in Kazakh) : Адамдардың мұрын-жұтқыншақ жағындылары қолданылды

Aim of work (in Russian) : провести популяционные исследования в отношении генотипов SARS-CoV-2, циркулировавших в Казахстане во время пандемии 2020 г., анализ их субгеномных характеристик и получить рекомбинантные белки SARS-CoV-2 для выработки научно-обоснованных подходов к диагностике COVID-19.

Aim of work (in Kazakh) : 2020 жылғы пандемия кезінде Қазақстанда айналымда болған SARS-CoV-2 генотиптеріне байланысты популяциялық зерттеулер жүргізу, олардың субгеномдық сипаттамаларын талдау және COVID-19 диагностикасына ғылыми негізделген тәсілдерді әзірлеу үшін SARS-CoV-2 алмастырылған ақуыздарын алу

Методы исследования (на русском) : компьютерный анализ нуклеотидных и белковых последовательностей, обратная транскрипция и транскрипция in vitro, ПЦР, ОТ-кПЦР, секвенирование ДНК нового поколения (NGS) и по Сэнгеру, методы молекулярного клонирования, аффинная (IMAC) хроматография белков, выделение и электрофорез ДНК, РНК и белков, иммуноблоттинг, спектрофотометрия, методы статистики

Методы исследования (на казахском) : нуклеотидтердің және ақуыздардың тізбегін компьютерлік талдау, кері транскрипция және in vitro транскрипция, КТ-сПТР (RT-qPCR), жаңа буынын секвенирлеу (NGS) және Сэнгер әдісі бойынша ДНҚ секвенирлеу, молекулалық клондау әдістері, тазартылған ақуыздар хроматографиясы (IMAC), ДНҚ, РНҚ және ақуыздарды бөлу және электрофорез, иммуноблоттинг, спектрофотометриялық, статистикалық талдау

Obtained results and novelty (in Russian) : 1) Проведено выделение РНК из 50631 клинических образцов и детекция РНК SARS-CoV-2 методом ОТ-кПЦР. 2) Разработаны праймеры и проведено частичное секвенирование участков генома 12 и SARS-CoV-2 образцов, а также полногеномное секвенирование (NGS) 137 образцов. 3) Проведено типирование с целью выявления генетических вариантов VOCs (подлежащих нотификации ВОЗ) SARS-CoV-2 (всего – 478 образцов). 4) Проведен скрининг субгеномных РНК вируса на различных этапах развития коронавирусной инфекции. 5) Клонированы участки коронавирусного генома, кодирующие белки S, M, N и Е, клонированные участки кДНК выверены секвенированием по Сэнгеру. 6) Проведена экспрессия кДНК S, M, N и Е SARS-CoV-2 в клетках Е. coli. 7) Рекомбинантные белки S, M, N и Е SARS-CoV-2 выделены методом хроматографии IMAC, очищены диализом, сконцентрированы. 8) Проведена характеристика эпидемиологии COVID-19 за 2021-2023 гг., исходя из полученных данных

Obtained results and novelty (in Kazakh) : 1) 50631 клиникалық үлгілерден РНҚ бөлініп алынған, SARS-CoV-2 РНҚ-ын КТ-сПТР әдісімен анықтау жүргізілді. 2) Праймерлертізбелері әзірленді және үлгілердің 12 және SARS-CoV-2 геномдық учаскелерінің ішінара реттілігі, сондай-ақ 137 және үлгілердің толық геномдық реттілігі (NGS) жүргізілді 3) SARS-CoV-2 (барлығы – 478 үлгі) VOCs (ДДҰ дәлелдеуге жататын) генетикалық нұсқаларын анықтау мақсатында типтеу жүргізілді. 4) Коронавирус инфекциясын дамуының әртүрлі кезеңдерінде вирустың субгеномдық РНҚ скринингі жүргізілді. 5) Коронавирус геномының S, M, N және E ақуыздарын реттейтін аймақтары клондалған, кДНҚ клондалған аймақтары Сэнгер секвенирлеуі арқылы тексерілді. 6) E. coli жасушаларында S, M, N және E SARS-CoV-2 кДНҚ экспрессиясы жүргізілді. 7) SARS-COV-2 рекомбинантты S, M, N және E ақуыздары IMAC хроматография әдісімен бөлінген, диализбен тазартылған, шоғырланған. 8) Алынған мәліметтерге сүйене отырып, 2021-2023 жылдар аралығындагы COVID-19 эпидемиологиясына сипаттама жасалды

The main constructive and technical economic indicators (in Russian) : Разработаны и синтезированы праймеры и пробы. Получены генетические конструкции, содержащие кДНК четырех белков SARS-CoV-2. Синтезированы и очищены рекомбинантные белки SARS-CoV-2.

The main constructive and technical economic indicators (in Kazakh) : Праймерлер тізбегі мен сынамалар әзірленді және синтезделді. Төрт SARS-CoV-2 ақуызының кДНҚ-ы бар генетикалық құрылымдар алынды. SARS-CoV-2 рекомбинантты ақуыздары синтезделді және тазартылды.

Level of implementation (in Russian) :

Level of implementation (in Kazakh) :

Efficiency (in Russian) : Все работы выполнены в полном объеме и в срок.

Efficiency (in Kazakh) : Барлық жұмыстар толық көлемде және белгіленген мерзімде орындалды.

Field of application (in Russian) : эпидемиология, молекулярная генетика, вирусология

Field of application (in Kazakh) : эпидемиология, молекулалық генетика, вирусология