Inventory number IRN Number of state registration
0223РК00121 AP09058580-OT-23 0121РК00286
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 2 Publications Web of science: 2 Publications Scopus: 2
Number of books Appendicies Sources
1 3 62
Total number of pages Patents Illustrations
77 0 15
Amount of funding Code of the program Table
16942011 AP09058580 12
Name of work
Сравнительное изучение вирома Каспийского моря, как важная составляющая сохранения биоразнообразия и биобезопасности Казахстана
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Базы, банки данных
Report authors
Алексюк Мадина Сапарбаевна , Алексюк Павел Геннадьевич , Молдаханов Ергали Сламидинович , Аканова Куралай Сайлауовна , Анаркулова Эльмира Избасаровна , Иманғазы Анар Сайлауқызы , Манакбаева Адолат Нахтбекқызы ,
0
1
1
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) Нет
Full name of the service recipient
ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abbreviated name of the service recipient ТОО "Научно-производственный центр микробиологии и вирусологии"
Abstract

Образцы окружающей среды, бактериофаги, виром.

Қоршаған орта үлгілері, бактериофагтар, виром.

Изучение биоразнообразия вирусов Каспийского моря и зависимости качественного и количественного состава вирома от экорегиона Каспийского моря.

Каспий теңізіндегі вирустардың биоалуантүрлілігін және вирустың сапалық және сандық құрамының Каспий теңізінің экологиялық аймағына тәуелділігін зерттеу.

Экологические, вирусологические и молекулярно-биологические

Экологиялық, вирусологиялық және молекулалық биологиялық

Впервые проведено сравнительное исследование 18 виромов, полученных из проб воды Северного и Центрального Каспия, и определено генетическое разнообразие ДНК-вирусов. В результате биоинформатической обработки было установлено, что количество вирусных последовательностей варьировало от 1,1% до 47,4%. Таксономическая классификация выявленных вирусных последовательностей установила их принадлежность к 17 вирусным семействам, 1 роду (Marseillevirus) и 1 группе вирусов (Haloviruses), поражающие архей. Анализ состава автохтонных вирусов выявил до 888 виротипов в северокаспийских и до 718 виротипов в обрацах центрального Каспия. При этом доминирующее количество виротипов относилось к бактериофагам. Фаги Puniceispirillum phage HMO-2011, Pelagibacter phage HTVC010P, Dinoroseobacter phage vB_DshS-R5C, Synechococcus phage S-CBS3, Cellulophaga phage phi38:1, Synechococcus phage ACG-2014f, Prochlorococcus phage P-TIM68 имели наибольшую представленность в исследуемых образцах обоих регионов Каспийского моря. В результате сравнительного изучения состава доминирующих аллохтонных вирусов были идентифицированы последовательности четырех семейств: Herpesviridae, Alloherpesviridae, Adenoviridae и Papillomaviridae. В процентном соотношении данные семейства преобладали в северном экорегионе, по сравнению с центральным. Доминирующим из идентифицированных семейств являлось семейство Herpesviridae.

Алғаш рет Солтүстік және Орталық Каспий теңізінің су үлгілерінен алынған 18 вирусқа салыстырмалы зерттеу жүргізіліп, ДНҚ вирустарының генетикалық әртүрлілігі анықталды. Биоинформатиканы өңдеу нәтижесінде вирустық тізбектердің саны 1,1%-дан 47,4%-ға дейін өзгеретіні анықталды. Анықталған вирустық тізбектердің таксономиялық жіктелуі олардың архейге әсер ететін 17 вирустық отбасына, 1 тұқымға (Marseillevirus) және 1 вирустар тобына (Haloviruses) жататындығын анықтады. Автохтонды вирустардың құрамын талдау Солтүстік Каспийде 888-ге дейін және Орталық Каспий үлгілерінде 718-ге дейін виротиптерді анықтады. Бұл жағдайда виротиптердің басым саны бактериофагтар болды. Puniceispirillum phage HMO-2011, Pelagibacter phage HTVC010P, Dinoroseobacter phage vB_DshS-R5C, Synechococcus phage S-CBS3, Cellulophaga phage phi38:1, Synechococcus phage ACG-2014F, Prochlorococcus phage P-TIM68 фагтар Каспий теңізінің екі аймағының да зерттелген үлгілерінде ең көп ұсынылған. Доминантты аллохтонды вирустардың құрамын салыстырмалы зерттеу нәтижесінде төрт отбасының тізбегі анықталды: Herpesviridae, Alloherpesviridae, Adenoviridae және Papillomaviridae. Пайыздық қатынаста бұл отбасылар орталық экорегионмен салыстырғанда Солтүстік экорегионда басым болды. Анықталған отбасылардың басым бөлігі Herpesviridae тұқымдасы болды.

Методом метагеномного анализа было проведено изучение биоразнообразия вирусов 18 образцов Каспийского моря и зависимости качественного и количественного состава вирома от экорегиона Каспийского моря. В ходе данной работы из проб Каспийского моря был выделен бактериофаг, обладающий широким спектром литической активности в отношении патогенных штаммов E. coli. По резуьтатам было опубликовано 6 работ, 2 работы из них в высокорейтинговых журналах базы данных Scopus и Web of Science.

Метагеномдық талдау әдісімен Каспий теңізінің 18 үлгісіндегі вирустардың биоалуантүрлілігін және вирустың сапалық және сандық құрамының Каспий теңізінің экорегионына байланысты тәуелділігін зерттеу жүргізілді. Осы жұмыс барысында Каспий теңізінің сынамаларынан E. coli патогендік штамдарына қатысты литикалық белсенділіктің кең спектрі бар бактериофаг бөлінді. Нәтижелері бойынша 6 жұмыс жарияланды, оның 2 жұмысы Scopus және Web of Science деректер базасының жоғары рейтингті журналдарында жарияланды.

Связана с мониторингом вирусного разнообразия водных экосистем , и возможным использованием бактериофагов в качестве новой системы биоиндикации экологического состояния водоёмов.

Су экожүйелерінің вирустық әртүрлілігін бақылаумен және су объектілерінің экологиялық жағдайын биоиндикациялаудың жаңа жүйесі ретінде бактериофагтарды қолдану мүмкіндігімен байланысты.

UDC indices
578.4; 574,5
International classifier codes
34.25.29; 34.35.33;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
Каспийское море; Экорегион; Виром; Биоразнообразие; Секвенирование;
Key words in Kazakh
Каспий теңізі; Экорегион; Виром; Биоалуантүрлілік; Секвенирлеу;
Head of the organization Саданов Аманкелди Курбанович Доктор биологических наук / профессор, академик КазНАЕН
Head of work Алексюк Мадина Сапарбаевна Доктор философии (PhD) в области экологии / нет
Native executive in charge